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TCGA数据库Cox比例风险回归模型视频教程

时间:2018-07-16 20:09来源:原创 作者:BioWolf 点击:
TCGA数据库分析可以得到差异基因,提取简单的临床信息,生存时间和生存状态,合并临床和差异基因数据,做Cox比例风险模型,是当前TCGA数据库挖掘的热门课题。

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适用人群
TCGA数据挖掘的科研人员,癌症相关研究人员,生物信息学分析员,生物、计算机相关专业师生,医学研究人员
课程概述
学习本课程需要有一定的TCGA数据库基础,如果没有接触过TCGA数据库,请先学习我们的课程“TCGA数据库差异分析”,这节课的知识是基于TCGA数据库差异分析基础之上的。Cox用于肿瘤和其它慢性病的预后分析,也可用于列队研究的病因探索,能处理多因素对生存时间影响的问题。用9个课时的时间,做Cox单因素、多因素分析、生存分析、ROC曲线、高低风险热图绘制。
同时提供课程需要的脚本文件,老师在线回答学员问题。
本课程是生物信息学专业课程,需要用到一些专业术语,遇到不明白的可以提问或者直接检索。
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课程目录:
课时1:TCGA数据库Cox分析简介
课时2:Cox分析数据合并
课时3:单因素Cox分析
课时4:多因素Cox分析数据准备
课时5:Cox多因素分析
课时6:TCCGA数据库Cox生存分析
课时7:绘制ROC曲线
课时8:Cox热图数据准备
课时9:Cox分析热图绘制
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