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TCGA甲基化驱动基因高级课程

时间:2018-07-19 06:30来源:原创 作者:biowolf.cn 点击:
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TCGA数据库挖掘又推出一门课程,甲基化驱动基因分析,是继TCGA基础课程,cox风险回归模型,ceRNA网络构建,TCGA甲基化差异分析生存分析之后的又一力作,从此TCGA挖掘又5门课程,是学习分析的好资料,是论文开题的领路人。甲基化驱动基因课程是TCGA甲基化差异分析生存分析的高级课程,是当前分析的热点,对论文思路构建写作有很大的帮助。

TCGA数据库包括丰富的数据类型和肿瘤类型,不需要任何费用即可获得大量数据,其次在TCGA下载的数据已经经过了前期繁琐的标准化处理,节省了人工处理时间和资源。 

甲基化驱动基因分析,主要用到MethyIMix分析方法:1、计算基因甲基化水平和基因表达相关性,找到显著相关的基因。

2、对样品甲基化程度构建混合模型(mixture model)

3、Wilcoxon rank test计算正常组和处理组的差异甲基化

4、对计算的p值进行矫正

课程包括以下及部分的内容:

1、甲基化驱动基因课程简介

2、甲基化驱动基因数据准备

3、甲基化驱动基因MethyIMix数据分析

4、甲基化驱动基因MethyIMix绘制图形

5、甲基化驱动基因热图绘制

6、甲基化驱动基因PATHWAY分析
甲基化驱动基因
甲基化驱动基因
甲基化驱动基因

 


责任编辑:森莘
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