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TCGA甲基化数据下载差异分析生存分析课程试学

时间:2018-07-22 06:21来源:原创 作者:biowolf.cn 点击:
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TCGA数据库挖掘又推出一门课程,甲基化分析,是继TCGA基础课程,cox风险回归模型,ceRNA网络构建之后的又一力作,从此TCGA挖掘又4门课程,TCGA的三剑客到TCGA的四大金刚,是学习分析的好资料,是论文开题的领路人。

 

TCGA数据库包括丰富的数据类型和肿瘤类型,不需要任何费用即可获得大量数据,其次在TCGA下载的数据已经经过了前期繁琐的标准化处理,节省了人工处理时间和资源。 
 

TCGA甲基化课程讲解TCGA数据库甲基化数据下载提取,差异分析, 热图绘制。基因甲基化和表达相关性,位点甲基化和表达现骨干性,生存分析,甲基化和表达联合生存分析。
同时提供课程需要的脚本文件,老师在线回答学员问题。 
本课程是生物信息学专业课程,需要用到一些专业术语,遇到不明白的可以提问或者直接检索。 
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Illumina Human Methylation 450K BeadChip芯片可检测人全基因组近450,000个甲基化位点,具有单碱基的分辨率。全面覆盖了96%的CpG岛,并根据需求加入了CpG岛以外的CpG位点、人类干细胞非CpG甲基化位点、正常组织与肿瘤(多种癌症)组织差异甲基化位点、编码区以外的CpG岛、miRNA启动子区域和GWAS疾病相关区域的位点,同时覆盖了Human Methylation27 BeadChip的90%的位点。






责任编辑:森莘
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