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TCGA数据库挖掘癌症肿瘤临床TNM分期

时间:2017-10-31 15:28来源:原创 作者:森莘 点击:
TCGA数据库分析地位如此重要,比较主要的一个因素就是同时有表达量数据和临床数据,结合表达量数据和临床数据可以做很多分析,虽然没有SEER数据库肿瘤临床信息全面,但详细的TN
很多分析肿瘤的学员,都会问到,如何做TNM分期分析,如何得到临床数据,如何合并表达数据和临床数据。带着这些问题,我们首先给大家介绍一下TNM分期:
恶性肿瘤的TNM分期是按照解剖来进行分类分类的比较成熟的分期系统,它符合了对于恶性肿瘤进行分期的大部分要求,是目前国际上最为通用的分期系统。恶性肿瘤的一个重要特征就是随着时间的推移,其体积与侵犯的范围会逐渐增大。一般来讲,肿瘤侵犯的范围越大其预后也更差,可选择的治疗手段也就越来越有限,疾病的不同进展阶段治疗模式的选择也有差异,因此就需要一种根据病变范围指定的分期系统将临床上有共性的一组病例进行分类治疗。
目前TNM分期已经成为临床医生和医学科学工作者对于恶性肿瘤进行分期的标准方法。AJCC和UICC在实践中逐步提出了一套循证医学理论,以保住TNM分期适应临床及科学研究的需求。这一理论主要知道评价TNM分期系统的有效性和可靠性;基于疾病进展状况描述新的预后因素谱;对现有分期系统进行批判分析。TNM分期系统是基于肿瘤的范围(T是肿瘤一词Tumor的首字母),淋巴结播散情况(N是淋巴结一词英文Node的首字母),是否存在转移(M是转移一词英文Metastasis的首字母)完成的。
有学员经常会问,如何才能得到TNM分期这样重要的临床数据,生信自学网给大家准备了提取的代码,可以直接联系客户,或者在生信商城购买代码。
肿瘤临床TNM分期
TNM的临床分期
T——原发肿瘤的范围
Tx:无法评估原发肿瘤
T0:未发现原发肿瘤的证据
Tis:原位癌
T1、T2、T3、T4:原发肿瘤的大小和(或)局部侵犯的范围一次递增
N——有无区域淋巴结转移以及范围
Nx:无法评估区域淋巴结的情况
N0:未出现区域淋巴结转移
N1、N2、N3:区域淋巴结的侵犯范围一次递增
注:除区域淋巴结以外的任何淋巴结转移都被划分为远处转移
M——有无远处转移
Mx:无法评估远处转移的情况
M0:未出现远处转移
M1:发生远处转移
学习了生信自学网录制关于XML提取临床数据的课程,就可以得到TCGA数据库肿瘤临床数据,根据上面的说明,就可以轻松知道TNM分期的含义了。
在某些部位还可以进一步分级,比如T可以分成T1a,1b或N2a,2b,M1a,1b等。对待特定部位的分期,具体需要单个癌症的分期。根据TNM的不同组合,恶性肿瘤被分为I、II、III、IV期。I期的肿瘤通常是相对早期的肿瘤有着相对较好的预后。分期越高意味着肿瘤进展程度越高。实际上在临床工作中,每一个部位的肿瘤常常会使用2个TNM分期,一个是临床分期(cTNM或THM),一个是病理分期(pTNM)。
那么TNM分期的知识就介绍到这里,学习生信课程,上生信商城shop.biowolf.cn。

责任编辑:乐伟
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