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GEO芯片多分组样本的基因芯片分析步骤

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发表于 2017-9-5 14:45:03 | 显示全部楼层 |阅读模式
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把如例所示的多样本仅仅分为两组(EVI1-Empty),得到的DEGs仅有16个(|logFC|>2,p<0.05)、38个(|logFC|>1,p<0.05)。所以当我进行GO和KEGG pathway分析的时候,发现Number(Cluster)=0、FDR>1(甚至有100的)。

在经过进一步了解后,贴出如下正确方法:

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