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TCGA临床病理随访资料解读

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发表于 2017-9-13 20:26:56 | 显示全部楼层 |阅读模式
生信自学课堂
本帖最后由 哆啦咦 于 2017-9-14 10:59 编辑

胃癌的临床资料,TCGA对每一种类型的数据命名都是统一的,不管使用哪种工具下载只要是工具没有对其重新命名那么都可以对照本文的例子来解读,比如gender表示性别这都是通用的。

胃癌临床病理资料做例子介绍一下:

首先矩阵的样子如下:

从图中可以看出,TCGA的胃癌的临床病理共有156项,可谓是非常详细,我们常常用的无非就性别,年龄,TMN,Stage,是否转移,随访时间,是否死亡等等,从上述的表格中这些都能找到:


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