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共表达网络构建蛋白互作网络

视频课程讲解PPI蛋白互作网络构建,共表达分析,构建共表达网络

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共表达网络构建 

蛋白互作网络和共表达网络

主要内容:

蛋白互作网络的构建(String)

共表达网络构建

1、表达相关性

2、WGCNA

3、Cytoscape

如果是两个基因,可以直接使用表达相关性的方法,得到表达相关性

如果差异基因数目多,用WGCNA方法来做共表达

蛋白互作网络概念:

蛋白质的互相作用(PPI,Protein-protein interraction)是指蛋白质分子之间存在相互作用,可以从生物化学、信号转导和遗传网络的角度研究这种相关性

PPI网络中的每个节点代表一种蛋白质,节点之间有连线代表它们之间存在相互作用关系。圆圈代表基因,线条代表基因间存在相互作用,圆圈内部的结果代表蛋白的结构,线头颜色代表证明蛋白之间存在相互作用的不同证据。


共表达网络构建

共表达网络构建

共表达网络构建

  • 共表达网络构建蛋白互作网络
    • 产品名称:共表达网络构建蛋白互作网络
    • 录制平台:Windows
    • 电脑配置:Win10 8G
    • 视频课时:4个课时
    • 课程总时长:164分钟
    • 脚本语言:Perl&R语言
    • 资料大小:10.5M
    • 视频格式:一机一码MP4
    • 视频发送:网盘发货
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最有帮助的评价(4)

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    匿名用户 2018-10-07 20:32:02

    课程内容非常丰富,学到很多方法,实用好用

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    九零后医生 2018-01-13 13:44:34

    构建网络这个课程还是很实用,学习TCGA,用到这个课程结果已经出来了,老师解答还是很到位的。

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    Xinmin 2017-11-10 10:19:52

    很多论文都有网络图,学习了这个课程,我也可以加一个,乐老师很赞

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    manada16 2017-10-15 10:10:42

    这个课程很实用,做共表达分析,PPI网络构建

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共表达网络构建蛋白互作网络
共表达网络构建蛋白互作网络

视频课程讲解PPI蛋白互作网络构建,共表达分析,构建共表达网络

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