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单基因批量筛选

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发表于 2019-10-6 10:36:23 | 显示全部楼层 |阅读模式
生信自学课堂
单基因批量筛选
--生信自学网
       你是否因为找不到研究方向而苦恼呢?
       你面对着6万多个基因,找不到合适的基因而迷茫呢?
       这是很多学员面对的问题,正是因为学员有这样的烦恼,生信自学网录制了《TCGA单基因批量化筛选》的课程。
很多学员在做单基因研究的时候,发现很难找到合适的基因。有的基因生存分析没有意义,生存分析有意义的吧,可能独立预后分析没有意义。对于这些问题,我们有了统一的解决方案,主要步骤如下:
       1) 比较正常组织和肿瘤组织的差异,找出表达差异基因。
       2) 找出预后相关的基因,预后相关基因我们使用了两种方法。一种是km方法,将样品按照中位值分成两组,比较两组之间的差异;另一种是COX方法,将基因当作连续变量,比较基因和生存的关系。
      3) 独立预后分析,找出可以独立于其他临床性状,作为独立预后因子的基因。
      4) ROC曲线过滤,估计基因预测病人预后的准确性,挑选准确性高的基因。
      5) 临床相关性分析,找出跟临床具有相关性的基因。

       经过上述5个步骤之后,剩余的基因都是堪称完美的基因,既满足在正常和肿瘤中有差异,也和预后和临床具有相关性,同时可以作为独立预后因子,预测病人预后准确性还高。这样的基因可以满足我们发表文章的要求,具体可以看看生信自学网《TCGA单基因快速发文套路》视频。

       课程购买链接1:

      课程购买链接2:
              https://ke.biowolf.cn/biovideo-231.html





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