生信自学网-速科生物-生物信息学数据库挖掘视频教程

TCGA甲基化驱动基因高级课程

TCGA数据库挖掘又推出一门课程，甲基化驱动基因分析，是继TCGA基础课程，cox风险回归模型，ceRNA网络构建，TCGA甲基化差异分析生存分析之后的又一力作，从此TCGA挖掘又5门课程，是学习...

网站meta分析Stata软件操作R软件

用Stata14软件做网状meta分析，用R软件做网状meta分析，二分类变量、连续变量分别做网状meta分析。...

SEER数据库挖掘进阶课程多原发癌Joinpoint使用竞争

SEER数据库，是癌症分析利器，可以下载癌症样本详细的临床数据，高级进阶课程讲解如何从SEERStat下载数据，整理竞争风险模型输入数据，用R做竞争风险模型曲线图，SEERStat整理和下载...

转录组测序分析视频课程

本课程讲解转录组测序分析简介，数据准备与质控，比对和表达量计算，差异表达，新转录本和新lncRNA。 转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的...

小RNA测序数据分析视频课程

小RNA是一类长度在18-30nt的RNA分子，主要包括miRNA、siRNA和piRNA。小RNA能够调控基因的表达，在细胞的生长、发育、代谢等基础生物学过程中扮演着重要的角色。 课程讲解数据下载，质控...

外显子测序分析视频教程

外显子测序是指利用序列捕获技术将全基因组外显子区域DNA捕捉并富集后，再进行高通量测序的基因组分析方法。 外显子信息流程：下载数据库，下载原始数据，质控，比对，SNP、I...

多基因组比对和共线性分析视频教程

除了基因组成的相似性, 在不同基因组中基因排列顺序的一致性更能够体现基因组的共同起源, 这种基因排列顺序的一致性称为共线性(synteny, colinearity) 。 Progressivemauve是一款以java编写...

chip-seq生物信息分析视频教程

课程讲解chip-seq分析简介，质控比对分析，peak可视化，peak注释。 染色质免疫共沉淀技术（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP）也称结合位点分析法，是研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工...

16s测序分析高级视频教程

16S rRNA基因分子大小适中，突变率小，是细菌系统分类学研究中最常用和最有用的标志。16s课程讲解了QIIME下载安装、Linux命令、测序数据处理、OTU注释、Venny图热图绘制、样品Alpha及Bet...

全基因组关联GWAS分析视频教程

全基因组关联分析（Genome-wide association study）是指在人类全基因组范围内找出存在的序列变异，即单核苷酸多态性（SNP），从中筛选出与疾病相关的SNPs。...