这个课程是根据最新的文献(Identification of Hub Genes Associated With Development of Head and Neck Squamous Cell Carcinoma by Integrated Bioinformatics Analysis)录制。...
ggsci提供了一系列高质量的调色板,其灵感来自于科学期刊、数据可视化图书馆、科幻电影和电视节目中使用的色彩。ggsci中的调色板可以作为ggplot2级别提供。...
我们构建好蛋白互作网络后,就可以通过蛋白互作网络找出网络的核心基因。接下来我们就要使用cox方法找到预后相关的基因。在此之前,我们要准备好输入文件。...
我们已经对差异的基因构建了蛋白互作网络,接下来我们希望使用Cytoscape对这个网络进行可视化。...
TIMER是交互式web工具,能够全面、灵活地分析肿瘤浸润免疫细胞并可视化,如今,TIMER升级到了TIMER2.0版本。...
在我们找到了差异基因之后,我们想看一下这些差异基因之间是否具有蛋白互作的关系,这样我们可以通过构建这样的蛋白互作网络来查看...
GO富集分析就是观察我们的基因在哪些功能上具有富集,KEGG富集分析的目的是就是观察我们的差异基因在哪些通路上具有富集...
评分与LUAD患者的临床病理分期相关,免疫核心和StromalScore共享的DEGs主要表现为免疫相关基因的富集,PPI网络与单变量COX回归的交集分析,BTK表达与LUAD患者生存及TNM分期的相关性研究...