GEO NCBI数据下载与提取视频教程
时间:2017-08-16 来源:原创 作者:BioWolf
微信公众号:biowolf_cn 点击:次
| GEO NCBI数据库可以免费下载很多芯片数据，包括基因表达芯片，miRNA表达芯片，甲基化芯片，需要做差异分析，选择GEO数据库下载芯片数据是一个不错的选择。 在数据检索之前，我们需要知道自己研究的方向，这个方向有哪些关键字，做到心中有数，进入数据库可以检索相关数据，检索到数据之后就可以下载。 在芯片选择是需要注意一些问题，首先是芯片的时间，不能是很久以前的芯片，最好选择2010年以后的芯片数据，芯片样本，样本不要选择太少的，样本数目对后续差异分析非常关键，一般样本包括正常和Tumor；芯片平台，查看芯片品台，选择常用的平台，每个平台使用的基因ID有所不同，选择合适的平台，后续分析少很多工作，有些平台是直接用gene symbol，而有些用的是Ensembl ID，那么差异分析之前还要做ID转换。 如果手机不支持在线播放，那么可以选择电脑浏览器播放，或者关注微信公众号，里面有视频资料-免费视频教程，也可以学习免费视频。 (责任编辑：伏泽 微信：18520221056) 
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