GEO非肿瘤单基因生信套路(机器学习/随机森林树
时间:2023-04-13 来源:生信自学网 作者:伏泽
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课程目录:
非肿瘤单基因生信套路简介,软件准备,GEO数据下载,GEO数据注释,单个数据矫正,多个实验数据合并,PCA分析,差异分析,差异基因火山图,Lasso回归筛选疾病特征基因,SVM机器学习筛选疾病特征基因,随机森林树选疾病特征基因,交集特征基因,差异小提琴图,折线图,ROC曲线,验证组差异分析,验证组ROC曲线,基因分组的差异分析,共表达分析,GO富集分析,KEGG富集分析,GSEA富集分析,GSVA分析,免疫相关功能分析,免疫细胞浸润,免疫细胞柱状图,PCA分析,免疫细胞相关性,相关性气泡图,目标基因结合的miRNA,miRNA结合lncRNA,构建ceRNA调控网络。
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