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被忽视的SEER数据库可以挖宝

时间:2018-03-14 11:14来源:原创 作者:森莘 点击:
有很多学员问,GEO数据库发文确实简单,但是分值都很低;TCGA数据库越来越深入,可以发到高分文章,但在写在发表的太多,随便一问都是在挖掘TCGA;那么有没有一个数据量大,不容易

有很多学员问,GEO数据库发文确实简单,但是分值都很低;TCGA数据库越来越深入,可以发到高分文章,但在写在发表的太多,随便一问都是在挖掘TCGA;那么有没有一个数据量大,不容易出现重复,而且发文相对比较简单的数据库呢?

答案是肯定的,SEER数据库

专门保存癌症临床数据的数据库,应该是你迷茫之际的黄金库。

 

SEER数据库给大家准备了三门课程:

《SEER数据库基础分析》

《SEER竞争风险模型多原发癌Joinpoint软件绘图》

《SEER数据库列线图》

有学员就说,这个SEER数据库我也不懂,也没有接触过,该怎么快速学习了解一下SEER数据库呢?

老师当然会给大家准备好一些短文,让大家10分钟快速链接SEER数据库

生信自学SEER板块:http://www.biowolf.cn/SEER/

了解之后,学员就非常想知道,SEER数据库挖掘适合谁用,发文现状如何?

既然SEER数据库是癌症临床数据库,那么对于临床的医生、学生、导师,是最佳选择了,如果研究是癌症方向,那么发SEER的文章也是非常不错的选择;还有就是急着要毕业了,苦于没有好的研究课题,这个时候就可以和导师商量是否可以研究这样一个方向,开明的导师当然会给出合理的意见。

方向解决了,现在可以看看,SEER挖掘现在主要作哪些挖掘呢?

对于临床数据库,统计是最主打的,几个高大上的统计表格是每篇论文都会出现的:

再来一个统计表:


接下来是图:


怎么就可以了吗?这个自己想象,现在很多论文就是这个几个点的分析,就可以发到不错的文章,SEER数据库的数据库量是非常庞大的,有很多参数可以选择,很多数据可以筛选,所以出现重复的概率是很小的,这下不用担心像TCGA那样被人提前分析了。

当然还有加分点:

更重要的是,这些分析我们已经录制好课程,写好了代码,就等着学员们去挖掘,找到输入自己的数据宝藏。

 

 

责任编辑:森莘
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