TCGA数据库,是癌症分析利器,可以免费下载整体好的基因在样本的表达量。本课程是生物信息学系列课程中重要的课程之一,内容精简,操作简单,案例选取一个癌症为例,经过15个课...
GEO数据库,是差异基因分析利器,可以免费下载芯片数据和平台文件。GEO芯片分析课程是生物信息学系列课程一个重要部分,学习GEO芯片分析是生物信息学习的基础课程。...
适用人群 生物信息学科研人员,医学工作者,学校生物信息学教师、学生。 课程概述 Cytoscape软件功能强大,是生物信息学分析利器,可快速构建基因关系网络,得到论文报告需要的效...
GO功能富集分析,是差异基因分析非常常见和重要的一个环节,是论文报告的标配,熟练掌握GO富集分析,为差异基因分析提供很多便利。...
蛋白互作网咯是讲解使用String在线工具构建蛋白互作网络,共表达网络讲解表达相关性,WGCNA构建共表达网络,Cytoscape构建共表达网络。...
TCGA数据库分析可以得到差异基因,提取简单的临床信息,生存时间和生存状态,合并临床和差异基因数据,做Cox比例风险模型,是当前TCGA数据库挖掘的热门课题。...
TCGA数据库数据下载分网页下载和命令行下载,当文件数据比较大是,需要使用命令行下载。...
cBioPortal 网站整合了126个肿瘤基因组研究的数据,包括TCGA和ICGC等大型的肿瘤研究项目,涵盖了两万八千例标本的数据,此外部分样品还包括了临床预后等表型的信息。cBioPortal无需注册就...
生信自学网提供GEO芯片数据下载视频教程,学习生物信息学,视频教程更容易入门,操作更简单,希望对初级学员有帮助。...
差异基因功能富集分析非常重要,也很常见,这里讲解DAVID在线工具做GO功能富集分析,利用R软件做富集可视化分析。...
孟德尔随机化新版OpenGWAS的token申请使用...
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