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生信自学网-速科生物-生物信息学数据库挖掘视频教程

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  • [生信数据库] TARGET儿童肿瘤数据库下载临床和mRNA-seq数据 日期:2019-06-26 11:51:36 点击:3038 好评:2

    TARGET数据库是儿童肿瘤数据库,适合做儿童肿瘤分析和挖掘,对TCGA数据库做了很好的补充,而且针对性更强。...

  • [生信数据库] 单细胞RNA测序生信分析简介 日期:2019-06-19 12:09:29 点击:4031 好评:2

    单细胞测序是指在单个细胞水平上进行测序。单细胞转录组测序(single cell RNA ,scRNA-seq)是指对于单个细胞水平上将mRNA反转录扩增后进行高通量测序的技术。...

  • [生信数据库] 618生信自学网秒杀、团购、领券活动 日期:2019-06-16 09:18:33 点击:7542 好评:4

    618生信自学网为学员准备了丰富的秒杀活动,砍价活动,生信自学课堂领券优惠活动,回馈广大学员对生信自学网的大力支持...

  • [生信数据库] 环状RNA或成为新的癌症标志物 日期:2019-06-11 09:26:09 点击:5235 好评:2

    A Noncoding Regulatory RNAs Network Driven by Circ‐CDYL Acts Specifically in the Early Stages Hepatocellular Carcinoma。最新《Hepatology》:瞄准肝细胞癌早期筛查与精准治疗...

  • [生信数据库] GSEA富集分析如何操作(GO/KEGG的第三个富集分析) 日期:2019-05-13 13:52:33 点击:1164 好评:4

    除了做GO分析和KEGG分析外,最常用的,其实是GSEA分析(Gene Set Enrichment Analysis)。GSEA和普通的KEGG和GO分析不一样的地方,是GSEA构建了一个分子标签数据库(MolecularSignaturesDatabase,MSigDB)...

  • [生信数据库] Tumor microenvironment characterization in gastric cancer id 日期:2019-04-23 11:52:43 点击:1237 好评:4

    Tumor microenvironment characterization in gastric cancer identifies prognostic and immunotherapeutically relevant gene signatures 胃癌肿瘤微环境特征鉴定预后和免疫治疗相关基因特征...

  • [生信数据库] ArrayExpress数据库挖掘(类似GEO数据库的另一个芯片 日期:2019-04-19 06:46:27 点击:1638 好评:8

    ArrayExpress与Geo数据库类似,里面都存储这大量芯片表达数据,对于数据库挖掘的学员来说,ArrayExpress是一个不可或缺的数据库。...

  • [生信数据库] 小RNA测序分析数据下载miRNA、siRNA和piRNA 日期:2019-03-22 10:02:19 点击:1193 好评:4

    小RNA是一类是长度在18-30nt的RNA分子,主要包括miRNA、siRNA和piRNA。小RNA能够调控基因的表达,在细胞生长、发育、代谢等基础生物学过程中扮演着重要的角色。...

  • [生信数据库] 中药网络药理学分析思路探讨 日期:2019-01-17 14:50:45 点击:835 好评:-6

    网络药理学是基于系统生物学理论,对生物系统的网络分析,选取特定信号节点进行多靶点药物分子设计的新学科。...

  • [生信数据库] WGCNA生信分析 日期:2018-07-08 17:22:17 点击:1110 好评:6

    《WGCNA分析》课程 WGCNA(加权基因共表达网络分析)利用基因表达数据,构建出加权的基因共表达网络,从而挖掘协同表达的基因模块,探索 基因模块与性状之间的关系。该课程主要介...

  • [生信数据库] PCA主成分分析详解 日期:2018-05-06 11:21:56 点击:1499 好评:10

    今天给大家推荐的是主成分分析,是一种掌握食物主要矛盾的统计学分析方法,它可以从多元事物中解析出主要影响因素,揭示事物的本质,简化复杂的问题。...

  • [生信数据库] R语言学习资料大全(持续更新) 日期:2017-11-07 11:54:22 点击:2046 好评:2

    学习R语言可以利用很多资源,学习这些资源可以更好的学习R语言,生信分析R语言...

  • [生信数据库] 高通量测序数据发文思路 日期:2017-08-15 07:27:17 点击:2547 好评:8

    随着高通量检测(基因芯片/二代测序)价格的降低,全基因组检测也成为较为常规的实验之一。然而面对动辄几万个基因的高通量数据,后期的数据分析显得尤为重要。...

  • [生信数据库] TCGA差异基因做火山图 日期:2017-08-12 07:13:14 点击:6594 好评:2

    TCGA数据库数据下载得到表达矩阵,用表达矩阵做差异分析,可以得到差异基因,以及差异基因相关的logFC和矫正后的P值,利用这两列数据可以画一个火山图,直观表示差异基因的上调下...

  • [生信数据库] lncRNA深入分析方法 日期:2017-08-12 04:29:22 点击:1051 好评:0

    长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是长度大于 200 个核苷酸的非编码 RNA。 研究表明, lncRNA 在剂量补偿效应(Dosage compensationeffect)、表观遗传调控、细胞周期调控和细胞分化调控等众多生...

  • [生信数据库] miRNA命名规则 日期:2017-08-11 20:23:04 点击:1111 好评:0

    以动物microRNA为例 一、 确定命名规则之前发现的microRNA,则保留原来名字,如cel-let-7。 二、 在提交新的microRNA到数据库时,按照microRNA family顺序分别编号命名,如数据库中已有mir-41,那...

  • [生信数据库] Affymetrix芯片数据上传到GEO数据库 日期:2017-08-11 20:05:17 点击:675 好评:6

    GEO数据库上传芯片数据...

  • [生信数据库] circRNA环状RNA功能分析 日期:2017-08-09 07:08:49 点击:2257 好评:4

    circRNAs 由于其特有的结构和复杂的功能机制,对其研究起步较晚,但已证实其具有重要的调控作用并在疾病发生中发挥重要作用,成为 RNA 和转录组研究的热点。...

  • [生信数据库] PCA主成分分析 日期:2017-07-18 14:26:37 点击:694 好评:-2

    主成分分析(Principal Component Analysis,PCA), 是一种掌握事物主要矛盾的统计分析方法,它可以从多元事物中解析出主要影响因素,揭示事物的本质,简化复杂的问题。...

  • [生信数据库] RCircos圈图绘制 日期:2017-07-13 05:35:49 点击:1149 好评:0

    RCircos圈图用途广泛,特别是二代测序的文章,在很多文章都会用上圈图,SNP位点,基因的表达量,基因间的共表达关系,在生物学领域应用广泛。...

  • [生信数据库] 环状RNA测序数据分析 日期:2017-07-10 12:05:05 点击:313 好评:2

    环状RNA简介,环状RNA注释、鉴定,差异分析,生存分析...

  • [生信数据库] R语言&软件免费视频教程 日期:2017-07-04 10:56:37 点击:873 好评:0

    生物信息学R语言系列课程由biowolf.cn原创录制,旨在完善生物视频教程生态圈,满足广大学员对R语言深入学习的要求,在之前的生信课程中,经常用到R软件和R脚本,很多时候我们都会给...

  • [生信数据库] 转录因子结合位点TFBS预测 日期:2017-06-27 13:23:00 点击:429 好评:0

    课程讲解转录因子及转录因子结合位点的预测,转录因子能够结合在某因子上游特异核苷酸序列上的蛋白质,活化后从胞质转位至胞核,通过识别和结合基因启动子区的顺式作用原件,...

  • [生信数据库] 在线分析GDSC抗癌药物敏感性数据库 日期:2017-06-09 16:07:57 点击:1118 好评:4

    GDSC数据库进入网站就可以得到很多有用的数据,在线可以生成IC50半浓度图,火山图,单个多个癌症的药物敏感性散点图,所以说这个数据库非常实用。...

  • [生信数据库] GDSC抗癌药物敏感性数据库分析简介 日期:2017-06-09 15:59:16 点击:1933 好评:0

    抗癌药物敏感性基因组学(GDSC,Genomics of Drug Sensitibity in Cancer)有英国桑格研究院开发,收集肿瘤细胞对药物的敏感度和反应。癌基因组的变异会影响临床治疗的效果,不同的靶点对药...

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