天,我们先一起学习一下《Comprehensive evaluation of transcriptome-based cell-type quantification methods for immuno-oncology》,了解一下不同工具包的异同。...
corrplot包主要针对相关系数输出的结果进行可视化,可以实现选择颜色,文本标签,颜色标签,布局等的操作。...
Window安装基因集富集分析软件GSEA 基因集 富集分析 (Gene Set EnrichmentAnalysis, GSEA ),根据名称我们就可以知道这是一种对基因进行富集的工具和方法。 其基本思想是使用预设定的基因集...
上一篇文章我们讲了如何绘制折线图,这一次我们讲讲数据分布可视化的方法,直方图、密度图、箱线图、小提琴图等都是很好的实现形式...
ggplot2绘图结果往往X轴和Y轴的交点往往不是原点,调整坐标起始位点可以利用scale_y_continuous....
上一篇我们讲了绘制不同形态的条形图,这次我们讲绘制折线图和散点图。...
上一小节我们讲了ggplot2的基本介绍,这一小节我们讲解探索数据绘制不同形态的条形图。...
R语言里面一个比较重要的绘图包——ggplot2,核心理念是将绘图与数据分离,数据相关的绘图与数据无关的绘图分离,是按图层作图,有利于结构化思维,同时它保有命令式作图的调整...
由于列线图的包更新了,可能会出现问题,下面告诉大家一些解决办法。...
devtools安装SingleR和gganatogram包报错...
Cytoscape如何计算节点和边数目node和edge计数...
生信绘图pheatmap热图R软件色条控制小技巧...
网络药理学解答无法添加symbol注释的问题...
Tumor microenvironment characterization in gastric cancer identifies prognostic and immunotherapeutically relevant gene signatures 胃癌肿瘤微环境特征鉴定预后和免疫治疗相关基因特征 GEO/TCGA肿瘤微环境高分生信文...
CA神刊,渐行渐远的【医学四大刊】,逐渐落寞的“神刊”,医学各领域前十期刊,最新影响因子大于5的杂志...
在线工具一般具有“功能强大、操作简单、无需安装、用完就走”的特点,因此深受科研人员的喜爱。生信自学网在这里做个简单的整理。...
生信自学网开展团购活动,本周团购课程,《蛋白互作网络共表达网络构建》、《GEO/TCGA/Oncomine三大数据入门课程》,需要的小伙伴快点加入吧...
生信自学网2019年第一场线下培训跟大家见面了,由光俊老师亲自带大家一起做数据库挖掘。...
很多学员在学习了我们的课程之后,都表示我们的课程由非常多干货,出来的结果都非常正规,发表论文期刊和杂志非常乐意接受。...
GEO芯片分析,得到差异基因,如果分析差异基因相关性,除了可以做GO、KEGG富集分析,接下来最值得分析的就是蛋白互作网络,学习简单高效,在论文里面经常出现,蛋白互作网络构建...
学习“TCGA数据库基础课程”的学员,可以结合这个改版说明,更好的操作...
很多学员有这样的疑问,写论文需要用到很多分析方法,苦于不会编程,对数据库又不熟悉,学习生信自学网提供的视频课程是不需要编程基础的,课程提供原始数据和代码,只需要跟...
TCGA数据库有改版了,很多学员问道新版的TCGA数据库如何分析,和之前的分析方法有何不同,是不是需要跟着TCGA官方修改研究方案。...
在生信分析中常常遇到一些习惯问题,这些问题是非常容易忽略的,同时也是非常重要的,长期做生信分析,需要特别学习其中几个号习惯...
在TCGA数据库使用,分析的时候,经常会遇到一些问题,把学员经常遇到的问题规整一下,以便后续分析提高效率,少走弯路,当然很多问题会不断被发现解决,所以这个短文会持续更新...
R语言中的颜色问题,R软件绘图如何选择颜色,R语言如何调用颜色,颜色代码如何编写?...
在学习TCGA数据库基础课程时,没有很多学员被一些问题难住了,当然学习过程中遇到的问题都会老师专门解答,把经常问到的问题总结一下,供大家交流学习。...
学习生信的学员都绕不开R的安装,很多学员安装步骤都能很轻松的安装R,安装R包也很简单;但是也有部分学员,在R和R包的安装就被卡住了,无法继续,这个时候,不要心急,从多个方...
在网易云课程购买了生信自学网原创录制得生信视频课程,可以获取课程用到的数据和代码,同时可以在线给学员答疑。...
生物信息分析对于生物学、医学分析越来越重要,成为科研不可或缺的一部分,很多相关人员开始学习和使用生信分析,然而多年的工作和学习,电脑硬件不一定更新过,这就遇到尴尬...
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上一篇文章我们讲了如何绘制折线图,这一次我们讲讲数据分布...
ggplot2绘图结果往往X轴和Y轴的交点往往不是原点,调整坐标起始位...
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