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  • [TCGA] 基于ssGSEA的免疫基因集简介和分析过程 日期:2019-09-04 16:05:02 点击:6525 好评:0

    ssGSEA——单样本GSEA的方法,通过这个方法,我们可以得到每个样本的免疫细胞或者免疫功能,免疫通路的活性,然后根据免疫活性进行分组。...

  • [TCGA] 自噬基因预后模型文章套路课程试学 日期:2019-08-13 17:41:13 点击:6651 好评:0

    自噬基因预后模型文章套路视频(autophagy/多指标ROC曲线)...

  • [TCGA] 自噬相关基因和肿瘤的关系 日期:2019-08-12 15:30:09 点击:3385 好评:2

    如何用TCGA数据库做自噬相关基因预后分析,是生信分析的一个新的热点和难点,自噬相关基因的重要性决定了其研究的重要地位。...

  • [TCGA] 自噬基因的简介和下载自噬基因 日期:2019-08-11 17:48:07 点击:5358 好评:2

    如何获取自噬基因::网址:http://www.autophagy.lu/...

  • [TCGA] TCGA甲基化分析再续经典课程 日期:2019-07-31 11:03:12 点击:1544 好评:10

    TCGA甲基化分析是当前分析的热点,也是TCGA分析的蓝海,具有很强的分析价值。...

  • [TCGA] Cox比例风险回归模型发文思路 日期:2019-07-31 11:01:54 点击:2153 好评:6

    TCGA数据库挖掘,癌症分析首选数据库,Cox比例风险回归模型是TCGA分析一个非常重要的方法,同时也是一个发文热点。...

  • [TCGA] 甲基化和基因表达联合分析 日期:2019-07-31 10:43:11 点击:2711 好评:10

    继TCGA基础课程、Cox风险模型、ceRNA网络构建课程推出之后,在学员强烈要求下,我们的程序员、授课老师合理规划,协同合作,经过半年的努力,终于推出了《TCGA甲基化基础课程》、《...

  • [TCGA] TCGA临床数据整理分析课程 日期:2019-07-31 10:18:06 点击:4608 好评:20

    这注定是个不平凡的夏天,世界杯正在热播,我们的研究没有停歇,在这个忙碌的夏天,我们精心录制了三个课程,现在各平台均已上线,各位学员在看世界杯的空余,可以学习课程,...

  • [TCGA] TCGA突变数据如何做分析? 日期:2019-07-31 09:32:37 点击:3824 好评:34

    TCGA突变数据分析...

  • [TCGA] 基于TCGA数据库肿瘤免疫细胞浸润分析流程 日期:2019-07-31 09:25:20 点击:3088 好评:12

    在这个分析思路中,最关键的一步就是如何用CIBERSORT这个软件把基因矩阵转换为免疫细胞矩阵。...

  • [TCGA] 3到11分文章解读(肿瘤免疫浸润挖掘方向) 日期:2019-07-31 09:24:43 点击:6012 好评:30

    免疫浸润是一个非常经典的思路,通过简单的基因矩阵数据,我们将复杂实验才能提取的免疫细胞含量直接计算出来,对科研工作非常有帮助。今天我们来讲讲,通过肿瘤免疫浸润分析...

  • [TCGA] GEO、TCGA、Oncomine应该选择哪一个? 日期:2019-07-30 11:42:41 点击:3894 好评:12

    大数据时代,生物数据越来越多了,数据库也越来越多了,各种各样的基因芯片数据库、蛋白质数据库...琳琅满目...

  • [TCGA] TCGA数据库肿瘤微环境挖掘肿瘤免疫评分基质评分 日期:2019-07-30 11:40:51 点击:4358 好评:10

    在肿瘤微环境中,免疫细胞和基质细胞是两种主要类型的非肿瘤组分,并且已被提出对于肿瘤的诊断和预后评估具有价值的。...

  • [TCGA] TCGA数据库肿瘤突变负荷分析(TMB/tumor mutation burd 日期:2019-07-30 11:40:22 点击:4083 好评:14

    肿瘤突变负荷是一个比较热门的分析,而且频繁用于各大医院临床应用,通过肿瘤突变负荷的程度,可以预测生存期,以及病人的免疫治疗的疗效。...

  • [TCGA] m6A RNA甲基化生物信息学挖掘思路 日期:2019-07-30 11:31:39 点击:3643 好评:4

    RNA修饰是一种转录后水平的调控方式,目前已鉴定到超过150种RNA修饰,它们广泛分布于各类RNA,如信使RNA(mRNA)、转运RNA(tRNA)、核糖体RNA(rRNA)、非编码小RNA(sncRNA)和长链非编码...

  • [TCGA] m6A-RNA甲基化(m6A RNA methylation)5分纯生信文章解读 日期:2019-07-30 11:29:37 点击:2809 好评:4

    m6A RNA methylation文章解读...

  • [TCGA] GTEx数据库联合TCGA做分析 日期:2019-07-30 11:21:55 点击:3245 好评:6

    TCGA数据库癌旁样本少(没有癌旁)怎么办? GTEx数据库联合TCGA做分析 通常我们在挖掘TCGA数据库的时候,会发现该项目纳入的正常组织测序结果是非常少的,也就是说很多病人都不会有...

  • [TCGA] 还在傻傻的说TCGA没有癌旁?GTEx来助力 日期:2019-07-30 07:26:55 点击:5955 好评:6

    你是否遇到这样的问题,TCGA癌旁太少甚至没有,做免疫做到后面癌旁样本只剩下5个一下的个位数,审稿人冷不丁的来一句这么少的癌旁有没有意义?那么有了GTEx数据库,有正常样品助...

  • [TCGA] TMB肿瘤突变负荷的诞生和热门 日期:2019-07-30 07:13:23 点击:5581 好评:4

    既然免疫治疗是否有抗癌效果,主要依赖于免疫细胞对癌细胞特异性抗原的识别;那么,从理论上讲,那些携带基因突变越多的癌症患者,癌细胞产生的新抗原越多,被免疫细胞识别的...

  • [TCGA] 十万样本深度挖掘TMB和PD-1 日期:2019-07-30 07:11:53 点击:4331 好评:2

    详细分析了10万例肿瘤患者的标本和临床资料,深度解析了有关TMB、PD-1抑制剂、MSI以及遗传物质错误修饰等关键问题。...

  • [TCGA] 如何分组做COX模型验证 日期:2019-07-29 23:12:44 点击:5762 好评:4

    COX模型验证如何分train组和test组,可以购买生信自学网录制的专利视频课程《COX模型验证》...

  • [TCGA] 7种可变剪接类型(TCGA可变剪切) 日期:2019-07-29 23:03:55 点击:7274 好评:2

    《TCGA数据库可变剪切数据挖掘》5分套路分析课程正在制作,大家可以重点了解下7种可变剪切类型。...

  • [TCGA] TCGA数据库可变剪切文献解读 日期:2019-07-29 23:01:26 点击:5822 好评:4

    Genome-Wide Profiling of Prognostic Alternative Splicing Signature in Colorectal Cancer...

  • [TCGA] 可变剪切挖掘生信文章解读 日期:2019-07-29 22:59:57 点击:5635 好评:2

    【可变剪切文献解读】Alternative splicing events implicated in carcinogenesis and prognosis of colorectal cancer...

  • [TCGA] 8705例肿瘤样本可变剪切综合分析【文献解读】 日期:2019-07-29 22:54:11 点击:6857 好评:2

    Comprehensive Analysis of Alternative Splicing Across Tumors from 8,705 Patients,8705例肿瘤样本选择性剪切的综合分析...

  • [TCGA] TCGA甲基化驱动基因文献解读 日期:2019-07-29 22:48:58 点击:6582 好评:0

    Exploration of methylation‑driven genes for monitoring and prognosis of patients with lung adenocarcinoma 甲基化驱动基因监测肺腺癌患者预后的探讨...

  • [TCGA] TCGA数据库可变剪切数据挖掘简介 日期:2019-07-10 14:20:23 点击:5922 好评:2

    可变剪切(alternative splicing,AS),也叫做选择性剪切,指的是再mRAN前体到成熟mRNA的过程当中,不同的剪切方式使得同一个基因可以产生多个不同的成熟mRNA,最终产生不同的蛋白质。...

  • [TCGA] TCGA数据库后台是如何规范TCGA样品ID的? 日期:2019-03-01 12:33:14 点击:1504 好评:8

    TCGA数据库现在是生信分析的热点,生信自学网开创了用生信方法解读TCGA数据的先河,给研究者提供了新的研究方案。...

  • [TCGA] ceRNA网络构建发文套路SCI快速发文 日期:2018-03-13 13:28:16 点击:2796 好评:18

    学员又发文了,ceRNA网络构建,原来SCI发文可以通过学习做到,而且只要认真学习我们的课程,课程的数据和结果可以直接上论文。...

  • [TCGA] TCGA数据库挖掘甲基化分析 日期:2018-03-11 15:27:39 点击:4255 好评:6

    而你看到的课程,是我们3个生信大神老师,经过半年对TCGA数甲基化数据魔鬼化分析得到大作。...

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