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  • [TCGA] 绘制气泡图 日期:2020-09-28 20:25:49 点击:2782 好评:0

    免疫基因对最后一节教大家如何绘制GSEA富集结果的气泡图...

  • [TCGA] 如何下载基因集文件 日期:2020-09-28 18:53:03 点击:2614 好评:0

    这里教大家如何在GSEA上下载GO的数据集。...

  • [TCGA] GSEA输入文件的准备及富集分析 日期:2020-09-27 17:25:16 点击:2663 好评:0

    1、输入文件的准备 2、GSEA富集分析...

  • [TCGA] 如何绘制免疫细胞相关性的雷达图 日期:2020-09-27 16:38:26 点击:2664 好评:0

    雷达图可以用来展示免疫细胞相关性的结果...

  • [TCGA] 免疫细胞浸润与免疫细胞的相关性 日期:2020-09-25 20:58:03 点击:2705 好评:0

    1、免疫细胞浸润 2、免疫细胞的相关性...

  • [TCGA] TCGA与GEO的独立预后分析 日期:2020-09-24 20:44:49 点击:2756 好评:0

    独立要分析的目的就是看我们这个模型是否可以独立于其他的临床性状作为独立预后因子...

  • [TCGA] 生存分析绘制生存曲线 日期:2020-09-24 18:44:08 点击:2656 好评:0

    将病人分为高低风险两组后,我们能够绘制病人的生存曲线...

  • [TCGA] 预后免疫基因对的筛选和模型的构建 日期:2020-09-24 16:49:37 点击:2637 好评:0

    我们将免疫基因对生生存数据合并之后,我们就可以找出哪些免疫基因对和生存是相关的,接着就可以构建预后模型。...

  • [TCGA] CEO免疫基因对和生存时间进行合并 日期:2020-09-24 14:08:40 点击:2635 好评:0

    将CEO数据库免疫基因和生存时间进行合并,可以得到合并后的文件,用于做后续的预后分析。...

  • [TCGA] 签名预测浆液性卵巢癌的总生存率(三) 日期:2020-09-23 21:48:21 点击:2629 好评:0

    1、验证IRGPI签名的生存预测 2、不同危险人群的免疫细胞浸润 3、IRGPI签名的功能评估。...

  • [TCGA] 签名预测浆液性卵巢癌的总生存率(二) 日期:2020-09-23 21:32:12 点击:2607 好评:0

    免疫细胞浸润在大体积肿瘤中,基因本体(GO)与基因集富集分析(GSEA),统计分析。结果:预测IRGPs信号构建...

  • [TCGA] 签名预测浆液性卵巢癌的总生存率(一) 日期:2020-09-23 20:31:47 点击:2610 好评:0

    一篇关于免疫相关基因对签名预测浆液性卵巢癌的总生存率的研究文章。...

  • [TCGA] GEO数据库免疫基因表达量的提取 日期:2020-09-22 19:52:28 点击:2619 好评:0

    在上一篇文章中我们得到了GEO数据库的表达矩阵,接下来我们要做的就是从这个GEO的表达矩阵里面,把免疫基因的表达量提取出来。...

  • [TCGA] TCGA免疫基因对和生存时间合并 日期:2020-09-22 18:56:15 点击:2691 好评:0

    我们就可以用免疫基因的矩阵去构建免疫基因对,将TCGA的免疫基因 对和病人的生存时间合并,合并之后我们就可以得到这样的一个矩阵...

  • [TCGA] GEO数据的注释 日期:2020-09-21 16:15:02 点击:2641 好评:0

    根据平台文件,我们就可以将我们的探针的矩阵转化为基因的名字,得到我们基因的矩阵。...

  • [TCGA] 免疫基因对GEO数据下载 日期:2020-09-21 15:55:03 点击:2632 好评:0

    做免疫基因对的分析文章套路,我们还要下载一个数据,就是GEO的数据...

  • [TCGA] 提取TCGA免疫基因表达 日期:2020-09-21 12:59:55 点击:2632 好评:0

    得到了免疫相关的基因列表之后我们再从转录组的矩阵里面提取免疫基因的表达量。...

  • [TCGA] 胃癌患者临床数据整理 日期:2020-09-15 17:12:49 点击:2685 好评:0

    我们前面下载好的临床数据,每个样品一个文件,这样的文件可读性很差,我们就需要对这样的数据进行了整理。...

  • [TCGA] 免疫基因对id的转换及临床数据的下载 日期:2020-09-15 16:41:57 点击:2657 好评:0

    得到胃癌样品的矩阵后,我们要对其id进行转换,随后下载癌症患者的临床数据。...

  • [TCGA] TCGA转录组数据下载与整理 日期:2020-09-13 20:27:01 点击:2805 好评:0

    在做免疫基因对的TCGA联合GEO挖掘之前,我们先要下载转录组的数据,然后还要对下载好的数据进行整理。...

  • [TCGA] 免疫基因对文章套路视频 日期:2020-09-13 19:56:14 点击:2636 好评:0

    免疫基因对文章套路视频(TCGA联合GEO挖掘immune-related gene pairs)...

  • [TCGA] KEGG通路富集分析 日期:2020-09-10 20:26:42 点击:2771 好评:0

    通过通路富集分析,我们可以看一下我们关注的长非编码RNA,它是通过什么样的通路来调节癌症的发生。...

  • [TCGA] GO功能富集分析 日期:2020-09-10 20:15:44 点击:2678 好评:0

    这一篇文章我们就要向大家讲解id的转换和GO的功能富集分析....

  • [TCGA] 共表达预测lncRNA靶基因 日期:2020-09-09 20:49:38 点击:2748 好评:0

    lncRNA通过调控哪些功能和通路来影响我们肿瘤的发生,在发表文章的时候,这一部分几乎在所有的长非编码RNA发表的相关文章里面都会出现。...

  • [TCGA] 如何绘制生存状态图 日期:2020-09-08 20:39:00 点击:2675 好评:0

    上一篇文章我们介绍了如何绘制风险热图和风险曲线图,这一次我们教大家绘制最后一张生存状态图。...

  • [TCGA] 如何绘制风险热图和风险曲线 日期:2020-09-08 20:02:34 点击:2737 好评:0

    风险热图和风险曲线,是我们做生物信息分析常用的图形。如何绘制一张清晰的风险热图和风险曲线?下面就是我们要向大家介绍的。...

  • [TCGA] 绘制ROC曲线以及计算C-index值 日期:2020-09-07 21:16:21 点击:2671 好评:0

    这一篇文章我们向大家讲解一下ROC曲线的绘制和C-index值的计算。...

  • [TCGA] 多因素cox分析模型构建 日期:2020-09-07 19:37:03 点击:2681 好评:0

    多因素cox分析主要是为了构建生存模型,根据生存模型的公式计算每个病人的风险值。...

  • [TCGA] lncRNA风险生存曲线 日期:2020-09-07 19:29:01 点击:2621 好评:0

    根据病人风险的中位值,将病人分成高低风险两组,可以绘制生存曲线图。...

  • [TCGA] 提取单因素显著的lncRNA 日期:2020-09-06 20:02:52 点击:2632 好评:0

    通过单因素的cox分析得到跟生存相关的一些长非编码RNA,然后对其P值进行排序,选出满足条件的一些长非编码RNA来构建模型。...

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