Perl内置了正则表达式,处理文本字符串功能非常强大,是生物信息学编程最重要的编程语言之一。Perl语言在win系统操作也是非常方便的,直接在DOS环境下载,输入相关命令既可以运行,如果脚本设计合理,对内存的占用也是不高的。
Perl ,一般被称为“实用报表提取语言”(Practical Extraction and Report Language)。一般“Perl”,开头字母大写的 P,是指语言本身,你也可能看到“perl”,所有的字母都是小写的,开头字母小写的 p,是指程序运行的解释器,pl是perl文件的后缀。Perl 最初的设计者为拉里·沃尔(Larry Wall),他于1987年12月18日发表。Perl借取了C、sed、awk、shell scripting以及很多其他程序语言的特性。其中最重要的特性是它内部集成了正则表达式的功能,以及巨大的第三方代码库CPAN。简而言之,Perl象C一样强大,象awk、sed等脚本描述语言一样方便。自1987年1.0版本发布以来,Perl的用户数一直急剧增加,同时越来越多的程序员与软件开发者参与Perl的开发。