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课程概述

本课程讲解TCGA数据库差异表达分析和转录因子调控网络，是TCGA又一创新课程，是TCGA转录因子分析的重要学习课程。课程内容包括TCGA转录因子调控网络课程简介，TCGA官网数据下载，TCGA命令行下载数据，TCGA数据整理，Ensembl转换成symobl，提取mRNA，mRAN差异表达，差异mRNA热图绘制；提取lncRNA，lncRNA差异表达，差异lncRNA热图绘制，TCGA转录因子富集分析，转录因子调控网络文件准备，Cytoscape的下载和安装，转录因子调控网络可视化。
本课程是生物信息学专业课程，需要用到一些专业术语，遇到不明白的可以提问或者直接检索。