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CGGA数据库挖掘试学视频(胶质瘤研究/单基因批量

时间:2019-09-02 09:27来源:生信自学网 作者:乐伟 点击:
CGGA数据库挖掘试学视频(胶质瘤研究/单基因批量化筛选)

试学视频

课程主要内容:

课程主要内容:CGGA数据库简介,CGGA数据下载,批次矫正,表达和生存时间合并,生存分析过滤,独立预后分析过过滤,ROC曲线过滤,临床相关性过滤,挑选基因和生存输入文件准备,单基因生存曲线,单因素独立预后分析,多因素独立预后分析,ROC曲线绘制,临床相关性分析输入文件准备,临床相关性分析,GSEA输入文件准备,GSEA富集分析,多GSEA富集图,共表达分析,相关性热图绘制,相关性圈图绘制。

CGGA数据库是一个用户友好的网络应用程序,用于数据存储和分析,以探索来自中国队列2000多个样本的脑肿瘤数据集。该数据库包括全外显子测序(286)、DNA甲基化(159)、mRNA测序(1018)、mRNA微阵列(301)和microRNA微阵列(198)以及匹配的临床数据。分析工具允许用户浏览DNA突变谱、mRNA/micorrna表达谱和甲基化谱,并对特定的胶质瘤亚型进行相关性和生存率分析。

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