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TCGA泛素化文章套路视频(WGCNA共表达网络/转录因子

时间:2023-08-24 09:11来源:生信自学网 作者:伏泽 点击:
TCGA泛素化文章套路
课程目录:
泛素化文章套路,软件准备,转录组数据下载,转录组数据整理,临床数据下载,提取临床信息,提取泛素化基因的表达量,WGCNA筛选疾病特征基因,基因对,TCGA突变数据下载,计算肿瘤突变负荷,基因对和生存数据合并,构建预后模型,分组的临床统计分析,模型基因的差异分析,生存分析,PFS分析(无进展生存期),风险曲线,独立预后分析,ROC曲线,临床相关性分析,列线图,列线图ROC曲线,转录因子分析,增强子(eRNA)分析,GSEA富集分析,免疫细胞浸润,免疫细胞柱状图,免疫细胞差异分析,免疫相关功能差异分析,免疫检查点差异分析,肿瘤突变负荷差异分析,肿瘤突变负荷生存分析,微卫星不稳定性,药物敏感性(oncoPredict),药物敏感性差异分析,免疫组化(HPA数据库)
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