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R3.6.1安装Bioconductor包新的安装方法

时间:2019-08-19 16:59来源:生信自学网 作者:乐伟 点击:
R3.6.1更新之后,很多R包安装方法改变了
install.packages("ggplot2")

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("edgeR")

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("clusterProfiler")

视频学习:


R3.6.1软件下载地址:
链接:https://pan.baidu.com/s/1AGtP7Uqv_rLP8hLjK6d-ew
提取码:i8wx


修改之前是这样的:
source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("edgeR")
R包安装不了常见的错误:
1、R软件安装位置不对,因每台电脑硬件不同,建议安装在默认的C盘,并且在安装的时候,文件夹不要用空格或者特殊字符,否则安装R包经常出错
2、安装的工作目录没有权限,那么要找到R安装的工作目录,设置所有用户的所有权限
3、查看R的版本,尽量更新到最新版,因为R在一台电脑可以同时安装多个版本,所以旧版可以先不卸载,安装一个最新版
4、网络问题,建议用电信,其他宽带进外网确实阻力很大。如果网速不好,R都下载不完整,那根本安装不了的

然后再试下一次,下载完整,可以了:

5、如果以上方法还不行,可以考虑重启电脑试下。如果还是不行,可以把R包的zip文件下载到本地,尝试本地安装
6、再不行,就只能换个电脑试试了,有时候电脑32或者64位对R包安装也会产生影响。




责任编辑:乐伟
作者申明:本文版权属于生信自学网(微信号:18520221056)未经授权,一律禁止转载!
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