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糖酵解相关GSEA基因集下载

时间:2020-03-28 07:27来源:生信自学网 作者:乐伟 点击:
糖酵解相关GSEA基因集下载
GSEA官网:https://www.gsea-msigdb.org/gsea/index.jsp

数据下载:
1、进入主页,点击Downloads导航菜单

2、输入邮箱,点击login,如果还没有注册,可以注册一个账号,GSEA注册非常简单

3、进入下载页面,根据自己的操作系统选择合适的版本下载,比如win系统下载GSEA v4.0.3 for Windows

4、安装好之后,桌面就出现了GSEA的软件图标
5、点击页面导航菜单:Molecular Signatures Database,进入数据集下载页面

6、点击页面的搜索按钮:Search for gene sets by keyword.

7、进入搜索页面,在搜索框输入糖酵解的关键词:glycolysis,点击search按钮开始搜索

8、得到结果页面,在数字框下拉选择100,也就是显示所有相关数据集,这里我们可以选择数据集名称有glycolysis的数据集

9、选择好数据集,点击数据集的name,比如:BIOCARTA_GLYCOLYSIS_PATHWAY

10、进入BIOCARTA_GLYCOLYSIS_PATHWAY该数据集的页面,点击gmt按钮下载gmt文件,可以重命名为BIOCARTA_GLYCOLYSIS_PATHWAY.gmt

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责任编辑:乐伟
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