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自噬基因预后模型文章套路课程试学

时间:2019-08-13 17:41来源:生信自学网 作者:乐伟 点击:
自噬基因预后模型文章套路视频(autophagy/多指标ROC曲线)

课程目录
自噬预后模型简介,转录组数据下载,转录组数据整理,ID转换,临床数据下载,临床数据整理,提取自噬相关基因,自噬相关基因差异表达,箱线图绘制,基因symbol转换为id,GO富集分析,GO气泡图,KEGG富集分析,KEGG圈图绘制,自噬基因和生存时间合并,预后相关的自噬基因,自噬基因的预后模型,生存曲线绘制,风险曲线绘制,独立预后分析输入文件,独立预后分析,多指标ROC曲线,临床相关性分析文件准备,临床相关性分析。
基本概念
自噬和肿瘤关系

自噬(autophagy)是将细胞内受损、变性或衰老的蛋白质以及细胞器运输到溶酶体进行消化降解的过程。
自噬在肿瘤中也扮演着这样的双面角色。正常生理情况下,细胞自噬利于细胞保持自稳状态,细胞自噬还可以防止致癌的损伤蛋白质和细胞器的累积,抑制细胞癌变。然而肿瘤一旦形成,细胞自噬为癌细胞提供更丰富的营养,促进肿瘤生长。
在大多数情况下,自噬被认为是抑制早期肿瘤发生,促进已形成的肿瘤发展。
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