知识的价值不在于占有,而在于使用。

生信自学网-速科生物-生物信息学数据库挖掘视频教程

当前位置: 主页 > TCGA >

自噬相关基因和肿瘤的关系

时间:2019-08-12 15:30来源:生信自学网 作者:乐伟 点击:
如何用TCGA数据库做自噬相关基因预后分析,是生信分析的一个新的热点和难点,自噬相关基因的重要性决定了其研究的重要地位。
自噬是细胞在自噬相关基因(autophagy related gene,Atg)的调控下利用溶酶体降解自身受损的细胞器和大分子物质的过程。对实现细胞代谢需要、更新某些细胞器并维持细胞内稳态有较重要的作用。

近几年,自噬研究的热度不减,国自然相关研究的中标数量也呈增长趋势,在2016年,自噬相关研究被授予了诺贝尔生理医学奖

自噬是一种非常基础的生命活动现象,它可能参与生命活动的方方面面,比如肿瘤、炎症、免疫应答、氧化应激等。通常情况下,除了研究自噬现象本身,大家更多的是将自噬与各种生命活动或者疾病结合起来,把自噬作为这些方向的一个机制来研究。
比如研究自噬如何参与肿瘤的发生发展、如何参与肿瘤的耐药性与复发转移、如何参与肿瘤免疫治疗的效果、自噬如何参与炎症反应、自噬如何参与氧化应激,甚至自噬如何参与自闭症、阿兹海默症的发生与治疗等。
 
自噬是真核细胞维持内环境稳态的一种内在平衡机制。大量证据表明自噬通路在多种疾病与生理过程中起着重要作用,如:神经系统疾病、肿瘤、心血管疾病、感染、代谢性疾病、自身免疫性疾病等等,自噬通路也就成为是很多疾病潜在的靶向治疗通路。大隅良典因发现细胞自噬机制获得2016年度的诺贝尔生理学或医学奖
什么是自噬?
Autophagy(自噬)来自于希腊语,是auto=self和phagy=phagein=to eat的结合。细胞是怎么吃掉自己(self-eating)的呢?大致是一个通过膜将部分胞质和细胞内需降解的细胞器、蛋白质等组分包裹起来形成自噬体,后与溶酶体融合形成自噬溶酶体,最终降解其所包裹的内容物的过程。
自噬发生可以大概总结为以下几个阶段:
自噬泡(phagophore)的发生
自噬体(autophagosome)的形成
自噬的运输融合(fusion):自噬体与溶酶体融合形成自噬溶酶体
自噬的降解(degradation)
 
近年来的研究表明,自噬参与恶性肿瘤、神经退行性疾病、组织纤维化、心血管疾病和免疫性疾病等多种疾病的发生和发展。按照细胞内底物被降解的方式和运送到溶酶体腔方式的差异,自噬被分为3 种类型:巨自噬(macroautophagy)、微自噬(microautophagy)、分子伴侣介导的自噬(chaperone-mediate autophgy)。因为巨自噬发生的普遍性,在大多数情况下巨自噬就是通常所说的自噬, 也是目前研究的最详细的一种自噬形式。巨自噬不仅能降解大分子物质和细胞器来保护细胞,也通过自噬介导细胞发生自噬性细胞死亡,是真核生物细胞内调节降解蛋白、细胞器的主要机制。人类的疾病过程复杂,自噬与肿瘤之间的关系也未能完全明确。

在有些肿瘤中,自噬可以抑制肿瘤细胞的生长,激活细胞的程序性死亡。另外,自噬也可以通过多种机制和信号途径对肿瘤的发生、发展进行双向调节,使细胞在应激条件下得以存活,所以自噬对肿瘤的影响并不是单方面的有利或有害,其具体情况要对癌症类型进行区别。自噬相关的多种关键分子被广泛深入研究,发现该过程在酵母和人类中表现出高度的进化保守性。一系列酵母中自噬相关基因的同源物在哺乳动物中被广泛发现,其中几个核心的自噬相关基因在自噬体形成所必需的两个泛素化系统中起作用。

生信自学课堂精品课程推荐:
免疫基因预后模型5分文章套路
《TCGA免疫细胞浸润模式挖掘》
《TCGA肿瘤微环境》
《TCGA肿瘤突变负荷》

《单基因文章套路基于TCGA数据库》


责任编辑:乐伟
作者申明:本文版权属于生信自学网(微信号:18520221056)未经授权,一律禁止转载!
加生信自学网群
BioWolf二维码生成器
顶一下
(2)
66.7%
踩一下
(1)
33.3%
------分隔线----------------------------
发表评论
请自觉遵守互联网相关的政策法规,严禁发布色情、暴力、反动的言论。
评价:
表情:
用户名: 验证码:点击我更换图片
TCGA肿瘤微环境
推荐内容
单基因发文套路
m6A