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如何绘制生存状态图

时间:2020-09-08 20:39来源:生信自学网 作者:刘鑫 点击:
上一篇文章我们介绍了如何绘制风险热图和风险曲线图,这一次我们教大家绘制最后一张生存状态图。

绘制生存状态图

上一篇文章我们介绍了如何绘制风险热图和风险曲线图,这一次我们教大家绘制最后一张生存状态图。
 

我们先来看一下我们要得到的生存状态图

 
生存状态图,它的横坐标和前面我们提到的两张图是一样的,也是将病人按照风险值由低到高排序。排序好了之后,我们就把病人的生存时间标上去,也就是说我们这里的纵坐标就是病人的生存时间,然后我们也会把这个病人的生存状态通过不同颜色的点标上去,红色的点它代表病人已经死亡,绿色的点就代表这个病人还存活着。
所以从这个图里面我们可以看到随着这个风险值的增大,死亡的病例越来越多,然后同时我们也可以看到生存时间,左边的生存时间相对于右边来说要高一些,随之风险的增大,生存时间也就降低了,死亡的人数也就增加了。
 
下面我们来绘制这个图形,绘制这个图形的输入文件和前一篇文章讲的一样,也是risk.txt文件,脚本文件的话是我们自己准备好的文件,大家可以通过购买我们的课程获得该套课程的学习视频和脚本文件。
 


通过R运行我们的脚本文件,我们就可以得到我们需要的生存状态图了。


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