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m6A RNA甲基化5分文章套路(肿瘤分型/RNA修饰)试学

时间:2019-05-19 09:49来源:生信自学网 作者:乐伟 点击:
m6A RNA甲基化5分文章套路视频(肿瘤分型/RNA修饰)
m6A RNA甲基化
RNA修饰是一种转录后水平的调控方式,目前已鉴定到超过150种RNA修饰,它们广泛分布于各类RNA,如信使RNA(mRNA)、转运RNA(tRNA)、核糖体RNA(rRNA)、非编码小RNA(sncRNA)和长链非编码RNA(lncRNA)。
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RNA甲基化修饰约占所有RNA修饰的60%以上,而m6A(6-甲基腺嘌呤)是高等生物mRNA上最为常见的一类RNA甲基化修饰。转录本m6A的修饰水平受甲基转移酶(编码器)、结合蛋白(读码器)和去甲基化酶(消码器)的动态调控。
甲基转移酶(编码器):KIAA1429、METTL3、METTL14、RBM15、WTAP、ZC3H13
结合蛋白(读码器):HNRNPC、YTHDC1、YTHDC2、YTHDF1、YTHDF2
去甲基化酶(消码器):ALKBH5、FTO

生信自学网新课程目录:
m6A文章套路简介
数据下载
数据整理
基因名转换
提取m6A相关基因表达量
m6A相关基因差异表达
m6A热图绘制
m6A小提琴图绘制
m6A相关性分析
肿瘤分型
主成分分析
临床数据下载
临床信息提取
分型生存分析输入文件准备
分型生存分析
分型临床相关性输入文件准备
分型与临床相关性检验
分型临床相关性热图绘制
生存模型输入文件准备
单因素COX分析
lasso回归模型
风险生存曲线
ROC曲线
风险临床相关性输入文件准备
风险与临床相关性检验
风险与临床相关性热图
独立预后输入文件准备
单因素独立预后分析
多因素独立预后分析


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