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miRNA芯片数据挖掘文章套路
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  • [课程试学] GEO芯片分析视频教程 日期:2018-07-20 06:40:46 点击:1530 好评:-2

    GEO数据库,是差异基因分析利器,可以免费下载芯片数据和平台文件。GEO芯片分析课程是生物信息学系列课程一个重要部分,学习GEO芯片分析是生物信息学习的基础课程。...

  • [课程试学] Cytoscape软件视频教程 日期:2018-07-20 06:38:41 点击:1745 好评:2

    适用人群 生物信息学科研人员,医学工作者,学校生物信息学教师、学生。 课程概述 Cytoscape软件功能强大,是生物信息学分析利器,可快速构建基因关系网络,得到论文报告需要的效...

  • [课程试学] GO功能富集视频教程 日期:2018-07-20 06:36:32 点击:894 好评:-4

    GO功能富集分析,是差异基因分析非常常见和重要的一个环节,是论文报告的标配,熟练掌握GO富集分析,为差异基因分析提供很多便利。...

  • [课程试学] 蛋白互作网络和共表达网络构建视频学习教程 日期:2018-07-20 06:34:57 点击:895 好评:0

    蛋白互作网咯是讲解使用String在线工具构建蛋白互作网络,共表达网络讲解表达相关性,WGCNA构建共表达网络,Cytoscape构建共表达网络。...

  • [课程试学] miRNA靶基因预测功能分析视频学习教程 日期:2018-07-20 06:32:07 点击:737 好评:0

    miRNA靶基因预测是差异miRNA分析最重要的一步,如何获知miRNA的功能,可以通过预测miRNA靶基因的功能富集,推测miRNA的功能。miRNA靶基因预测的工具非常多。...

  • [课程试学] SEER数据库分析视频学习教程 日期:2018-07-20 06:30:08 点击:3685 好评:0

    SEER数据库是癌症分析非常实用的数据库,是北美最具代表性的大型肿瘤登记注册数据库之一,收集了大量循证医学的相关数据,为临床医师的循证实践及临床医学研究提供了系统的证据...

  • [课程试学] 甲基化分析视频课程 日期:2018-07-20 06:28:19 点击:580 好评:2

    讲解450K甲基化芯片,覆盖了96%的CpG岛,主要讲解从GEO数据库下载甲基化芯片,包括质控、归一化、差异甲基化位点、差异甲基化区域、差异甲基化区域注释。...

  • [课程试学] lncRNA靶基因预测视频课程 日期:2018-07-20 06:26:36 点击:590 好评:6

    lncRNA靶基因预测,是lncRNA研究利器,lncRNA靶基因功能富集可以预测lncRNA的功能。...

  • [课程试学] ceRNA调控网络构建(生物信息学视频教程/TCGA数据 日期:2018-07-20 06:24:32 点击:677 好评:4

    ceRNA调控网络构建课程是TCGA数据库深度挖掘教程,课程从基础的数据下载,数据整理,到差异分析,比对分析,数据准备,网络构建,到最后得到网络,并对网络中的DE进行生存分析。...

  • [课程试学] 16s测序分析(生物信息学视频/二代测序分析) 日期:2018-07-20 06:23:10 点击:645 好评:0

    16S rRNA基因分子大小适中,突变率小,是细菌系统分类学研究中最常用和最有用的标志。...

  • [课程试学] GEO高级教程视频教学 日期:2018-07-20 06:21:05 点击:608 好评:0

    GEO芯片分析是生物信息学基础课程,需要掌握,广大学员提出宝贵意见,精心录制GEO高级教程,多芯片联合分析,多芯片联合分析不是简单的做交集,而是利用RobusRank包做差异分析,得...

  • [课程试学] KEGG富集分析视频课程 日期:2018-07-20 06:19:03 点击:364 好评:0

    KEGG富集通路分析,是差异基因分析非常常见和重要的一个环节,是论文报告的标配,熟练掌握KEGG富集分析,为差异基因分析提供很多便利。 本课程内容精简,操作简单,精选案例,经...

  • [课程试学] GSEA富集分析视频课程 日期:2018-07-20 06:15:37 点击:406 好评:0

    GSEA根据已有的对基因的定位、功能、生物学意义等知识的基础上,首先构建了一个分子标签数据库,数据库中包括了多个功能基因集。通过分析基因表达数据,得到表达状况是否在某种...

  • [课程试学] GDSC数据库分析视频课程 日期:2018-07-19 07:00:47 点击:206 好评:4

    GDSC数据库是抗癌药物敏感性数据库,收集肿瘤细胞对药物的敏感性和反应,这些数据对于发现潜在肿瘤治疗靶点十分重要。课程包括数据库简介、数据库在线操作(药物、基因及细胞系...

  • [课程试学] CMAP数据库小分子药物分析视频(生物信息学视频 日期:2018-07-19 06:59:09 点击:480 好评:0

    G小分子药物分析是对差异基因分析的一个重要补充,可以找到相关的小分子药物,利用CMAP数据库,就可以轻松找到小分子药物; 课程包括CMAP数据库简介,CMAP数据库输入数据准备,基...

  • [课程试学] 环状RNA分析视频教程(生物信息学视频/TCGA数据库 日期:2018-07-19 06:57:13 点击:261 好评:0

    课程讲解环状RNA测序分析,环形RNA式mRNA在剪接过程中,上游exon的5’端与3’端剪接到一起,从而形成的首位相接的环状RNA分析。本课程包括环状RNA简介,数据库准备和质控,比对到基因...

  • [课程试学] PCA主成分分析(生物信息学视频/GEO芯片分析) 日期:2018-07-19 06:55:32 点击:321 好评:0

    课程讲解PCA主成分分析, 主成分分析(Principal Component Analysis,PCA), 是一种掌握事物主要矛盾的统计分析方法,它可以从多元事物中解析出主要影响因素,揭示事物的本质,简化复杂...

  • [课程试学] 全基因组关联GWAS分析视频教程 日期:2018-07-19 06:53:37 点击:735 好评:2

    全基因组关联分析(Genome-wide association study)是指在人类全基因组范围内找出存在的序列变异,即单核苷酸多态性(SNP),从中筛选出与疾病相关的SNPs。...

  • [课程试学] RCircos圈图绘制视频教程 日期:2018-07-19 06:51:54 点击:413 好评:0

    RCircos R package绘制圈图,RCircos包支持Circos 2D数据轨道绘图,例如散点、线、柱状图、热图、连接器和文本标注。RCircos包直接从R中使用circos,免去了我们学习circos数据结构的过程,可以让...

  • [课程试学] chip-seq生物信息分析视频教程 日期:2018-07-19 06:49:54 点击:362 好评:-2

    课程讲解chip-seq分析简介,质控比对分析,peak可视化,peak注释。 染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)也称结合位点分析法,是研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工...

  • [课程试学] 多基因组比对和共线性分析视频教程 日期:2018-07-19 06:48:19 点击:343 好评:-2

    除了基因组成的相似性, 在不同基因组中基因排列顺序的一致性更能够体现基因组的共同起源, 这种基因排列顺序的一致性称为共线性(synteny, colinearity) 。 Progressivemauve是一款以java编写...

  • [课程试学] 外显子测序分析视频教程 日期:2018-07-19 06:46:41 点击:181 好评:0

    外显子测序是指利用序列捕获技术将全基因组外显子区域DNA捕捉并富集后,再进行高通量测序的基因组分析方法。 外显子信息流程:下载数据库,下载原始数据,质控,比对,SNP、I...

  • [课程试学] 小RNA测序数据分析视频课程 日期:2018-07-19 06:43:54 点击:198 好评:0

    小RNA是一类长度在18-30nt的RNA分子,主要包括miRNA、siRNA和piRNA。小RNA能够调控基因的表达,在细胞的生长、发育、代谢等基础生物学过程中扮演着重要的角色。 课程讲解数据下载,质控...

  • [课程试学] 转录组测序分析视频课程 日期:2018-07-19 06:41:31 点击:365 好评:0

    本课程讲解转录组测序分析简介,数据准备与质控,比对和表达量计算,差异表达,新转录本和新lncRNA。 转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的...

  • [课程试学] SEER数据库挖掘进阶课程多原发癌Joinpoint使用竞争 日期:2018-07-19 06:39:02 点击:799 好评:8

    SEER数据库,是癌症分析利器,可以下载癌症样本详细的临床数据,高级进阶课程讲解如何从SEERStat下载数据,整理竞争风险模型输入数据,用R做竞争风险模型曲线图,SEERStat整理和下载...

  • [课程试学] 网站meta分析Stata软件操作R软件 日期:2018-07-19 06:31:05 点击:610 好评:10

    用Stata14软件做网状meta分析,用R软件做网状meta分析,二分类变量、连续变量分别做网状meta分析。...

  • [课程试学] TCGA数据库Cox比例风险回归模型视频教程 日期:2018-07-16 20:09:32 点击:826 好评:10

    TCGA数据库分析可以得到差异基因,提取简单的临床信息,生存时间和生存状态,合并临床和差异基因数据,做Cox比例风险模型,是当前TCGA数据库挖掘的热门课题。...

  • [课程试学] R软件绘制热图视频课程 日期:2017-08-15 07:00:32 点击:227 好评:0

    本课程讲解使用R软件绘制热图,输入文件有两个,一个是差异基因表达量文件,一个是样本代号分类文件,对差异基因做聚类分析经常用到,论文报告上出现的频率高。 ...

  • [课程试学] 16s测序分析高级视频教程 日期:2017-08-15 06:58:59 点击:366 好评:0

    16S rRNA基因分子大小适中,突变率小,是细菌系统分类学研究中最常用和最有用的标志。16s课程讲解了QIIME下载安装、Linux命令、测序数据处理、OTU注释、Venny图热图绘制、样品Alpha及Bet...

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