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eRNA-增强子RNA生信简介

时间:2020-05-17 06:40来源:生信自学网 作者:乐伟 点击:
一类被称为增强子RNA(eRNA)的增强子转录的ncRNA被发现,eRNA的长度为0.5-5kb,因此可以分类为lncRNA。
在发育和分化过程中基因的表达涉及许多顺式调控DNA元件和反式作用蛋白的复杂机制的调控。调节基因转录的顺式调控DNA元件是启动子,绝缘子,增强子和沉默子。
增强子在人体生物学中具有关键性的作用。有研究曾构建了人类基因组中的增强子表达图谱,发现增强子在不同细胞类型之间存在差异性的表达 。另外与外显子相比,人类疾病相关的单核苷酸变异能够在增强子和启动子中得到更好的体现。

最近,一类被称为增强子RNA(eRNA)的增强子转录的ncRNA被发现,eRNA的长度为0.5-5kb,因此可以分类为lncRNA。
启动子是基因近端调控DNA元件,包括基础启动子元件。 基础启动子与一般转录因子相关联,招募和定位RNA聚合酶激活转录。而与启动子相反,增强子通常远离它们所调控的基因。增强子是一类DNA调节序列,其可以激活基因表达而不依赖于它们与其靶基因的距离或方向。增强子通常与其目标基因形成长程染色质循环,以在发育过程中控制时间和组织特异性基因表达,并且它们的错误调节促成人类疾病。

那么,eRNA是如何产生的?在增强子上的转录的第一个报道是在人类红细胞中β-珠蛋白簇的位点控制区,从那时起,在无数的增强子上检测到转录,且最近几年报道的数据最多。最初的报道集中在特定的增强子上,通常是多聚腺苷酸化的转录物,他们易被检测到,但这种情况并不常见。根据我们现在所知的,大多数来源于增强子的RNA是低水平的,一些活性增强子平均每个细胞产生1.3个转录本。因此,双向的,短的,非多腺苷酸化的转录物被忽略了这么长时间也就不足为奇了。


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