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蛋白互作&表达相关性&共表达网络一个课程搞定

时间:2018-03-13 14:18来源:原创 作者:森莘 点击:
GEO芯片分析,得到差异基因,如果分析差异基因相关性,除了可以做GO、KEGG富集分析,接下来最值得分析的就是蛋白互作网络,学习简单高效,在论文里面经常出现,蛋白互作网络构建

GEO芯片分析,得到差异基因,如果分析差异基因相关性,除了可以做GO、KEGG富集分析,接下来最值得分析的就是蛋白互作网络,学习简单高效,在论文里面经常出现,蛋白互作网络构建一般用String在线工具,结合cytoscape的MCODE包获取核心网络。

TCGA数据库差异分析也可以得到差异基因,如何分析两个基因之间的相关性,可以做基因相关形分析;当然也可以做蛋白互作网络构建。

WGCNA包的使用非常重要,用于分析基因模块分类,也是论文中非常常见的分析。

如果需要学习蛋白互作网络构建、基因相关性分析、WGCNA包的使用,接下来的这个课程一定适合您:《蛋白互作网络与共表达网络

如果对GEO、TCGA基础还不了解,请先学习《GEO基础课程》、《TCGA基础课程

当然也可以选择网易云课堂在线学习:生物信息学
1、蛋白互作网络

2、基因相关性

3、WGCNA

4、cytoscape

好的数据分析,怎么少得了可视化,Cytoscape是共表达作图神奇,一个专业的Cytoscape课程是画图的保障,学习《Cytoscpae软件操作


责任编辑:森莘
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