[TCGA] TCGA下载和提取临床数据 日期：2018-01-27 20:04:13 点击：47846 好评：48
TCGA数据库包含大体量数据，其中非常关键的是临床数据，公开这些临床数据，对科研工作有非常大的帮助，那么下载和提取临床数据显得非常关键和重要，可以说，提取临床数据是研究TCGA数据...
[TCGA] ceRNA调控网络构建-TCGA数据库挖掘 日期：2018-01-27 20:03:54 点击：13741 好评：10
ceRAN网络构建是基于竞争性内源RNA(ceRNA)假说，TCGA数据库下载和提取lncRNA表达数据，用edgeR包分别做差异，得到差异lncRNA、差异mRNA和差异miRNA，通过数据库，...
[TCGA] TCGA数据库定制ceRNA网络图聚类图热图 日期：2017-12-31 15:38:32 点击：2693 好评：10
老师从事生信分析8年，全职为广大学员提供专业的生物信息学视频教材，提供专业生信分析，定制生信图文，绘图定制服务。...
[TCGA] TCGA数据库基因表达差异和生存分析(生存曲线SC 日期：2017-12-31 15:15:16 点击：17703 好评：8
图形都是高清图，可以帮助大家发表论文使用。提供图形可直接用于文章发表文章，是高清的tiff格式图片（≥400dpi）。...
[TCGA] TCGA数据库单个基因也可以做GSEA富集分析 日期：2017-11-29 13:50:58 点击：3258 好评：-12
TCGA数据库单个基因GSEA富集分析，需要提供癌症分析的基因，以及癌症分析的类型。...
[TCGA] TCGA数据库乳腺癌BRCA挖掘 日期：2017-11-01 10:10:16 点击：6433 好评：6
乳腺癌（breaster cancer）是发生于乳腺上皮或导管上皮的恶性肿瘤。TCGA数据库保存了1000多个乳腺癌样本，属于样本信息非常齐全的肿瘤，同时临床信息也很齐全，是临床分析和学术研究的...
[TCGA] TCGA数据库挖掘癌症肿瘤临床TNM分期 日期：2017-10-31 15:28:44 点击：10593 好评：16
TCGA数据库分析地位如此重要，比较主要的一个因素就是同时有表达量数据和临床数据，结合表达量数据和临床数据可以做很多分析，虽然没有SEER数据库肿瘤临床信息全面，但详细的TN...
[TCGA] TCGA数据库生存分析绘制5年生存曲线 日期：2017-10-31 15:01:26 点击：9385 好评：0
TCGA数据库挖掘，可以做表达量差异分析，临床分析，结合表达和临床可以做生存分析，生存分析为了探索和了解影响生存时间长短的因素，或平衡某些因素影响后，研究某个或某些因素...
[TCGA] TCGA数据库Counts和FPKM以及FPKM-UQ 日期：2017-08-27 21:21:28 点击：30343 好评：28
在做TCGA数据库分析时，下载基因表达矩阵时，遇到一个选项，需要选择Counts、FPKM、FPKM-UQ，很多学员有点困惑，这些都是什么区别呢？...
[TCGA] TCGA数据库数据类型速查 日期：2017-08-23 22:47:37 点击：4756 好评：8
TCGA数据库包括mRNA表达数据、microRNA表达数据、拷贝数数据、蛋白质数据、基因突变数据以及甲基化数据...
[TCGA] 不做实验的生信分析可行吗？ 日期：2017-08-22 19:16:51 点击：11345 好评：42
随着生物测序的发展，生物数据越来越庞大，实验成本越来越高，对于普通的学生，或者是医务工作这，最佳研究思路就是结合实践或者专业知识，分析现有的数据库，也可以结合自用...
[TCGA] TCGA数据库完整临床数据全部提取 日期：2017-08-15 07:26:20 点击：29127 好评：-20
TCGA数据库33种癌症，完成临床数据，lncRNA矩阵，miRNA表达矩阵，mRNA表达矩阵，需要就可以直接联系获取...
[TCGA] 用命令行下载TCGA癌症数据 日期：2017-08-15 05:08:33 点击：5360 好评：22
TCGA数据库的数据量非常大，如何通过命令行下载数据，是很多学员遇到的问题，今天在这里给大家介绍如何使用命令行下载TCGA数据。...
[TCGA] TCGA表达数据分离mRNA和lncRNA矩阵 日期：2017-07-21 02:19:17 点击：9630 好评：8
上节课我们得到了TCGA的转录本数据文件，如何提取TCGA数据库的lncRNA矩阵，这节课将详细给大家讲解，有任何以为可直接加QQ：2749657388...
[TCGA] Cox比例风险回归模型分析 日期：2017-06-25 14:56:48 点击：5382 好评：10
Cox比例风险回归模型临床应用非常广泛，Cox分析得到的结果是可以直接运用到临床应用的，所以这个分析对癌症临床诊断有非常关键的作用，检测高低风险的关键基因，就可以预测病人...
[TCGA] Ensembl数据库的lncRNA分类 日期：2017-06-22 23:46:57 点击：6892 好评：8
Ensembl数据库的lncRNA分类，TCGA数据库挖掘是需要用到lncRNA的矩阵，这个时候就需要ID转换，lncRNA的分类就很重要。...
[TCGA] TCGA构建Cox比例风险回归模型 日期：2017-06-19 06:13:17 点击：1663 好评：0
Cox模型介绍，生存数据和表达数据合并，单因素Cox分析，多因素Cox分析，生存分析，ROC曲线，高低风险热图...
[TCGA] 癌症类型和样本代号详解TCGA 日期：2017-06-06 12:08:06 点击：55537 好评：62
癌症类型，TCGA数据库包括主要的32个癌症，样本代码，需要知道01C这个字段，01-09是tumor即癌症样本，10-29是normal即癌旁样本，那么马上来看看“一入TCGA深似海”吧...
[TCGA] 实战进入TCGA数据库癌症大数据时代 日期：2017-06-05 15:43:47 点击：2861 好评：20
把复杂的TCGA数据库讲通俗，让所有癌症工作者得到TCGA数据库的科研数据，独家分享TCGA实战经验。...
[TCGA] TCGAmiRNA做差异表达分析 日期：2017-06-05 14:19:50 点击：9382 好评：0
TCGA数据库挖掘涉及很多内容，这篇推文给大家讲解的是如何做TCGA数据miRNA差异表达分析...
[TCGA] TCGA下载和提取miRNA表达数据 日期：2017-06-05 14:01:22 点击：10269 好评：12
这节课给大家讲解TCGA数据库下载miRNA表达数据，用脚本提取矩阵数据...
[TCGA] TCGA下载基因表达数据并提取表达矩阵 日期：2017-06-05 13:59:45 点击：14035 好评：-4
这节课讲解如何从TCGA数据库下载mRNA表达数据，用gdc工具下载，得到原始文件，运行脚本提取mRNA矩阵数据。...
[TCGA] TCGA基因矩阵做差异表达 日期：2017-06-05 08:25:56 点击：4666 好评：8
TCGA数据库下载得到原始数据，原始数据处理得到矩阵，矩阵用来做差异分析。...
癌症相关成纤维细胞CAF生信套路...
1、免疫细胞浸润 2、免疫细胞的相关性...
这里教大家如何在GSEA上下载GO的数据集。...
临床数据的下载及整理...
肿瘤干细胞(Cancer Stem Cell, CSC),是指肿瘤中具有自我更新能力并能...
免疫基因对最后一节教大家如何绘制GSEA富集结果的气泡图...
