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  • [TCGA] TCGA数据库单个基因也可以做GSEA富集分析 日期:2017-11-29 13:50:58 点击:1233 好评:-4

    TCGA数据库单个基因GSEA富集分析,需要提供癌症分析的基因,以及癌症分析的类型。...

  • [TCGA] TCGA数据库乳腺癌BRCA挖掘 日期:2017-11-01 10:10:16 点击:1855 好评:6

    乳腺癌(breaster cancer)是发生于乳腺上皮或导管上皮的恶性肿瘤。TCGA数据库保存了1000多个乳腺癌样本,属于样本信息非常齐全的肿瘤,同时临床信息也很齐全,是临床分析和学术研究的...

  • [TCGA] TCGA数据库挖掘癌症肿瘤临床TNM分期 日期:2017-10-31 15:28:44 点击:2168 好评:16

    TCGA数据库分析地位如此重要,比较主要的一个因素就是同时有表达量数据和临床数据,结合表达量数据和临床数据可以做很多分析,虽然没有SEER数据库肿瘤临床信息全面,但详细的TN...

  • [TCGA] TCGA数据库生存分析绘制5年生存曲线 日期:2017-10-31 15:01:26 点击:1563 好评:0

    TCGA数据库挖掘,可以做表达量差异分析,临床分析,结合表达和临床可以做生存分析,生存分析为了探索和了解影响生存时间长短的因素,或平衡某些因素影响后,研究某个或某些因素...

  • [TCGA] TCGA数据库Counts和FPKM以及FPKM-UQ 日期:2017-08-27 21:21:28 点击:6475 好评:20

    在做TCGA数据库分析时,下载基因表达矩阵时,遇到一个选项,需要选择Counts、FPKM、FPKM-UQ,很多学员有点困惑,这些都是什么区别呢?...

  • [TCGA] TCGA数据库数据类型速查 日期:2017-08-23 22:47:37 点击:1631 好评:6

    TCGA数据库包括mRNA表达数据、microRNA表达数据、拷贝数数据、蛋白质数据、基因突变数据以及甲基化数据...

  • [TCGA] 不做实验的生信分析可行吗? 日期:2017-08-22 19:16:51 点击:5606 好评:38

    随着生物测序的发展,生物数据越来越庞大,实验成本越来越高,对于普通的学生,或者是医务工作这,最佳研究思路就是结合实践或者专业知识,分析现有的数据库,也可以结合自用...

  • [TCGA] TCGA数据库完整临床数据全部提取 日期:2017-08-15 07:26:20 点击:7866 好评:-6

    TCGA数据库33种癌症,完成临床数据,lncRNA矩阵,miRNA表达矩阵,mRNA表达矩阵,需要就可以直接联系获取...

  • [TCGA] 用命令行下载TCGA癌症数据 日期:2017-08-15 05:08:33 点击:2635 好评:22

    TCGA数据库的数据量非常大,如何通过命令行下载数据,是很多学员遇到的问题,今天在这里给大家介绍如何使用命令行下载TCGA数据。...

  • [TCGA] TCGA表达数据分离mRNA和lncRNA矩阵 日期:2017-07-21 02:19:17 点击:2816 好评:10

    上节课我们得到了TCGA的转录本数据文件,如何提取TCGA数据库的lncRNA矩阵,这节课将详细给大家讲解,有任何以为可直接加QQ:2749657388...

  • [TCGA] Cox比例风险回归模型分析 日期:2017-06-25 14:56:48 点击:2247 好评:10

    Cox比例风险回归模型临床应用非常广泛,Cox分析得到的结果是可以直接运用到临床应用的,所以这个分析对癌症临床诊断有非常关键的作用,检测高低风险的关键基因,就可以预测病人...

  • [TCGA] Ensembl数据库的lncRNA分类 日期:2017-06-22 23:46:57 点击:2394 好评:8

    Ensembl数据库的lncRNA分类,TCGA数据库挖掘是需要用到lncRNA的矩阵,这个时候就需要ID转换,lncRNA的分类就很重要。...

  • [TCGA] TCGA构建Cox比例风险回归模型 日期:2017-06-19 06:13:17 点击:297 好评:0

    Cox模型介绍,生存数据和表达数据合并,单因素Cox分析,多因素Cox分析,生存分析,ROC曲线,高低风险热图...

  • [TCGA] 癌症类型和样本代号详解TCGA 日期:2017-06-06 12:08:06 点击:16265 好评:46

    癌症类型,TCGA数据库包括主要的32个癌症,样本代码,需要知道01C这个字段,01-09是tumor即癌症样本,10-29是normal即癌旁样本,那么马上来看看“一入TCGA深似海”吧...

  • [TCGA] 实战进入TCGA数据库癌症大数据时代 日期:2017-06-05 15:43:47 点击:1533 好评:20

    把复杂的TCGA数据库讲通俗,让所有癌症工作者得到TCGA数据库的科研数据,独家分享TCGA实战经验。...

  • [TCGA] TCGAmiRNA做差异表达分析 日期:2017-06-05 14:19:50 点击:3750 好评:-2

    TCGA数据库挖掘涉及很多内容,这篇推文给大家讲解的是如何做TCGA数据miRNA差异表达分析...

  • [TCGA] TCGA下载和提取miRNA表达数据 日期:2017-06-05 14:01:22 点击:2566 好评:10

    这节课给大家讲解TCGA数据库下载miRNA表达数据,用脚本提取矩阵数据...

  • [TCGA] TCGA下载基因表达数据并提取表达矩阵 日期:2017-06-05 13:59:45 点击:3767 好评:2

    这节课讲解如何从TCGA数据库下载mRNA表达数据,用gdc工具下载,得到原始文件,运行脚本提取mRNA矩阵数据。...

  • [TCGA] TCGA基因矩阵做差异表达 日期:2017-06-05 08:25:56 点击:1506 好评:4

    TCGA数据库下载得到原始数据,原始数据处理得到矩阵,矩阵用来做差异分析。...

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