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  • [TCGA] TCGA数据库2018改版 日期:2018-03-03 20:29:18 点击:4225 好评:24

    新年新气象,TCGA迎来新一次改版,和以往的改版如出一辙,改动的是网页的格式和链接,数据并没有做修改,提供的指导性文件更多更人性话了,这也是所有TCGA研究者的福音。...

  • [TCGA] TCGA下载和提取临床数据 日期:2018-01-27 20:04:13 点击:16769 好评:48

    TCGA数据库包含大体量数据,其中非常关键的是临床数据,公开这些临床数据,对科研工作有非常大的帮助,那么下载和提取临床数据显得非常关键和重要,可以说,提取临床数据是研究TCGA数据...

  • [TCGA] ceRNA调控网络构建-TCGA数据库挖掘 日期:2018-01-27 20:03:54 点击:5810 好评:10

    ceRAN网络构建是基于竞争性内源RNA(ceRNA)假说,TCGA数据库下载和提取lncRNA表达数据,用edgeR包分别做差异,得到差异lncRNA、差异mRNA和差异miRNA,通过数据库,...

  • [TCGA] TCGA数据库定制ceRNA网络图聚类图热图 日期:2017-12-31 15:38:32 点击:1353 好评:10

    老师从事生信分析8年,全职为广大学员提供专业的生物信息学视频教材,提供专业生信分析,定制生信图文,绘图定制服务。...

  • [TCGA] TCGA数据库基因表达差异和生存分析(生存曲线SC 日期:2017-12-31 15:15:16 点击:7618 好评:8

    图形都是高清图,可以帮助大家发表论文使用。提供图形可直接用于文章发表文章,是高清的tiff格式图片(≥400dpi)。...

  • [TCGA] TCGA数据库单个基因也可以做GSEA富集分析 日期:2017-11-29 13:50:58 点击:1321 好评:-4

    TCGA数据库单个基因GSEA富集分析,需要提供癌症分析的基因,以及癌症分析的类型。...

  • [TCGA] TCGA数据库乳腺癌BRCA挖掘 日期:2017-11-01 10:10:16 点击:1950 好评:6

    乳腺癌(breaster cancer)是发生于乳腺上皮或导管上皮的恶性肿瘤。TCGA数据库保存了1000多个乳腺癌样本,属于样本信息非常齐全的肿瘤,同时临床信息也很齐全,是临床分析和学术研究的...

  • [TCGA] TCGA数据库挖掘癌症肿瘤临床TNM分期 日期:2017-10-31 15:28:44 点击:2367 好评:16

    TCGA数据库分析地位如此重要,比较主要的一个因素就是同时有表达量数据和临床数据,结合表达量数据和临床数据可以做很多分析,虽然没有SEER数据库肿瘤临床信息全面,但详细的TN...

  • [TCGA] TCGA数据库生存分析绘制5年生存曲线 日期:2017-10-31 15:01:26 点击:1830 好评:0

    TCGA数据库挖掘,可以做表达量差异分析,临床分析,结合表达和临床可以做生存分析,生存分析为了探索和了解影响生存时间长短的因素,或平衡某些因素影响后,研究某个或某些因素...

  • [TCGA] TCGA数据库Counts和FPKM以及FPKM-UQ 日期:2017-08-27 21:21:28 点击:7254 好评:22

    在做TCGA数据库分析时,下载基因表达矩阵时,遇到一个选项,需要选择Counts、FPKM、FPKM-UQ,很多学员有点困惑,这些都是什么区别呢?...

  • [TCGA] TCGA数据库数据类型速查 日期:2017-08-23 22:47:37 点击:1777 好评:6

    TCGA数据库包括mRNA表达数据、microRNA表达数据、拷贝数数据、蛋白质数据、基因突变数据以及甲基化数据...

  • [TCGA] 不做实验的生信分析可行吗? 日期:2017-08-22 19:16:51 点击:6562 好评:36

    随着生物测序的发展,生物数据越来越庞大,实验成本越来越高,对于普通的学生,或者是医务工作这,最佳研究思路就是结合实践或者专业知识,分析现有的数据库,也可以结合自用...

  • [TCGA] TCGA数据库完整临床数据全部提取 日期:2017-08-15 07:26:20 点击:8740 好评:-8

    TCGA数据库33种癌症,完成临床数据,lncRNA矩阵,miRNA表达矩阵,mRNA表达矩阵,需要就可以直接联系获取...

  • [TCGA] 用命令行下载TCGA癌症数据 日期:2017-08-15 05:08:33 点击:2863 好评:22

    TCGA数据库的数据量非常大,如何通过命令行下载数据,是很多学员遇到的问题,今天在这里给大家介绍如何使用命令行下载TCGA数据。...

  • [TCGA] TCGA表达数据分离mRNA和lncRNA矩阵 日期:2017-07-21 02:19:17 点击:3001 好评:10

    上节课我们得到了TCGA的转录本数据文件,如何提取TCGA数据库的lncRNA矩阵,这节课将详细给大家讲解,有任何以为可直接加QQ:2749657388...

  • [TCGA] Cox比例风险回归模型分析 日期:2017-06-25 14:56:48 点击:2465 好评:10

    Cox比例风险回归模型临床应用非常广泛,Cox分析得到的结果是可以直接运用到临床应用的,所以这个分析对癌症临床诊断有非常关键的作用,检测高低风险的关键基因,就可以预测病人...

  • [TCGA] Ensembl数据库的lncRNA分类 日期:2017-06-22 23:46:57 点击:2586 好评:8

    Ensembl数据库的lncRNA分类,TCGA数据库挖掘是需要用到lncRNA的矩阵,这个时候就需要ID转换,lncRNA的分类就很重要。...

  • [TCGA] TCGA构建Cox比例风险回归模型 日期:2017-06-19 06:13:17 点击:316 好评:0

    Cox模型介绍,生存数据和表达数据合并,单因素Cox分析,多因素Cox分析,生存分析,ROC曲线,高低风险热图...

  • [TCGA] 癌症类型和样本代号详解TCGA 日期:2017-06-06 12:08:06 点击:17488 好评:48

    癌症类型,TCGA数据库包括主要的32个癌症,样本代码,需要知道01C这个字段,01-09是tumor即癌症样本,10-29是normal即癌旁样本,那么马上来看看“一入TCGA深似海”吧...

  • [TCGA] 实战进入TCGA数据库癌症大数据时代 日期:2017-06-05 15:43:47 点击:1662 好评:20

    把复杂的TCGA数据库讲通俗,让所有癌症工作者得到TCGA数据库的科研数据,独家分享TCGA实战经验。...

  • [TCGA] TCGAmiRNA做差异表达分析 日期:2017-06-05 14:19:50 点击:4203 好评:0

    TCGA数据库挖掘涉及很多内容,这篇推文给大家讲解的是如何做TCGA数据miRNA差异表达分析...

  • [TCGA] TCGA下载和提取miRNA表达数据 日期:2017-06-05 14:01:22 点击:2846 好评:12

    这节课给大家讲解TCGA数据库下载miRNA表达数据,用脚本提取矩阵数据...

  • [TCGA] TCGA下载基因表达数据并提取表达矩阵 日期:2017-06-05 13:59:45 点击:4185 好评:2

    这节课讲解如何从TCGA数据库下载mRNA表达数据,用gdc工具下载,得到原始文件,运行脚本提取mRNA矩阵数据。...

  • [TCGA] TCGA基因矩阵做差异表达 日期:2017-06-05 08:25:56 点击:1626 好评:4

    TCGA数据库下载得到原始数据,原始数据处理得到矩阵,矩阵用来做差异分析。...

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