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列线图包更新说明

时间:2020-08-04 16:40来源:生信自学网 作者:刘鑫 点击:
由于列线图的包更新了,可能会出现问题,下面告诉大家一些解决办法。

列线图包更新说明

由于列线图的包更新了,可能会出现以下问题:

 
解决方案:
 
1. 我们可以打开输入文件,查看表头,观察我们需要分析的因素:
 

 
2. 然后把命令中的“点”改成我们需要做的分析因素的表头就可以了,例如我们的这个输入文件,我们把脚本中
f <- cph(Surv(futime, fustat) ~ . , x=T, y=T, surv=T, data=rt, time.inc=1)改成:
f <- cph(Surv(futime, fustat) ~ LOX+SPARC+MASTL+PI15+BMPR1B+ANKRD13B+PVT1, x=T, y=T, surv=T, data=rt, time.inc=1)
 
注:不需要的因素就不要放到公式里面,比如riskScore和risk。



责任编辑:乐伟
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