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METABRIC数据下载乳腺癌数据

时间:2019-12-24 07:23来源:生信自学网 作者:乐伟 点击:
METABRIC数据下载乳腺癌数据
数据下载
网址:http://www.cbioportal.org/
1、进入官网,点击“Data SET” 菜单

2、进入数据页面,在搜索框输入“metabric”

3、点击下载按钮,就可以把数据下载下来,METABRIC数据库只有乳腺癌的数据,所以下载数据非常简单
有学员会有以为,如果METABRIC数据库只有乳腺癌的数据,那么是不是只能做一次分析,剩下的都会重复,其实不然,我们课程用的是单基因筛选的方法,最后得到很多基因,然后根据自己的分析选择其中一个基因就可以做后续分析了。

4、接下来我们看下下载好的数据
Data_CNA.txt 拷贝数数据
Data_mRNA_median_Zscores.txt 表达数据(用Zscores方法矫正后的数据)
Data_clinical_patient.txt、data_clinical_sample.txt 保存了临床数据

那么我们新推出的课程用到的就是表达文件和临床文件
精品课程推荐:
《TCGA转录组和甲基化联合分析》
《TCGA免疫预后相关基因挖掘》
《GEO芯片联合中药复方网络药理学》



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