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  • [GEO] 如何结合GEO和TCGA快速发文癌症甲基化 日期:2018-05-06 17:12:43 点击:141 好评:2

    GEO数据库结合TCGA数据库,甲基化快速发文,看看SCI是如何操作发文的...

  • [GEO] GSEA富集分析 日期:2018-03-19 14:05:18 点击:824 好评:8

    GSEA富集分析是芯片分析一项重要的分析内容...

  • [GEO] 快速解决GEO芯片样本少的问题 日期:2018-03-11 08:52:58 点击:275 好评:2

    做GEO数据分析的时候,你是否因为样本量太少苦恼呢? 做共表达网络的时候,是否因为样品少图形看起来很low呢? 学员反映的这些问题,我们老师很快给出了明确回复。...

  • [GEO] GEO芯片分析思路探讨 日期:2017-08-15 07:26:34 点击:1428 好评:10

    利用R软件及affy、limma、pheatmap、ggplot2等R软件包进行数据挖掘及生物信息学分析。DAVID在线工具做GO功能分析,在GeneMANIA数据库做进一步研究。...

  • [GEO] Ensembl Gene ID转换成gene symbol ID 日期:2017-07-21 02:18:40 点击:952 好评:8

    基因ID种类很多,很多时候数据库下载的基因ID并不是symbol ID,那么就需要做个转换,当然不采用手工这种模式,需要使用程序自动转换,一个矩阵就有4-6万行记录。...

  • [GEO] NCBI表达谱芯片常用研究方法 日期:2017-06-09 10:01:03 点击:520 好评:6

    NCBI数据库可以下载大部分GEO表达谱芯片数据,一个简单实用的研究思路非常重要,安装可操作的思路,结合自己的研究方向,可以得到不错的分析结果。...

  • [GEO] NCBI数据库GEO芯片检索和下载 日期:2017-06-05 14:21:15 点击:1114 好评:12

    这节课给大家讲解如何从NCBI数据库检索GEO芯片,下载矩阵文件,用来做GEO芯片的差异分析。...

  • [GEO] Targetscan预测miRNA靶基因 日期:2017-06-05 14:12:48 点击:688 好评:4

    miRNA靶基因预测的工具非常多,如果使用单个预测工具,得到的靶基因数目非常多,这是需要利用做交集的办法,减少miRNA靶基因数据,得到更加准确的靶基因,使用的方法就是多个预测工具分...

  • [GEO] GEO表达谱芯片多个联合分析 日期:2017-06-05 14:08:48 点击:1445 好评:8

    GEO表达谱芯片分析的技术非常成熟,发表的相关论文也非常多,如果需要深入研究GEO表达谱芯片,多芯片联合分析提供了很好的思路,这样得到的差异基因,更加具有说服力;同时可以联合TC...

  • [GEO] 提取GEO表达谱芯片的数据矩阵 日期:2017-06-05 13:51:22 点击:1146 好评:14

    之前的课程我们讲解了如何从GEO数据库检索芯片数据,这节课给大家讲解如何从下载的数据中提取需要的矩阵文件。 下载的数据是压缩包格式,首先解压,得到soft文件,然后用UI文本编...

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