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METABRIC数据库的挖掘文章套路

时间:2020-07-16 18:58来源:生信自学网 作者:刘鑫 点击:
METABRIC(乳腺癌国际联盟的分子分类学)是一项加拿大与英国合作项目,旨在根据有助于确定最佳治疗过程的分子特征将乳腺肿瘤分类为更多的亚类。

METABRIC数据库的挖掘文章套路

在学习该课程前我们先来了解一下METABRIC数据库。METABRIC(乳腺癌国际联盟的分子分类学)是一项加拿大与英国合作项目,旨在根据有助于确定最佳治疗过程的分子特征将乳腺肿瘤分类为更多的亚类。METABRIC研究是一项涉及2000名乳腺癌患者的大型研究,揭示出乳腺癌能够被划分为10种亚型。METABRIC03研究是一项大型的分子分析研究,包括基因表法、拷贝数、基因突变和临床数据。
这个课程的主要内容我们把它分为三部分,第一部分我们先教大家如何下载临床数据和整理数据;第二部分我们要对这些数据进行过滤,我们通过生存分析过滤、独立预后分析过滤、ROC过滤以及临床相关性过滤四个过滤找出和乳腺癌相关的基因;第三部分我们在找到的乳腺癌相关基因里选一个基因作为单基因的文章套路来绘制图形,我们可以绘制生存曲线,ROC曲线,做独立预后分析、临床相关性分析、GSEA富集分析,最后进行共表达分析和圈图绘制。这就是我们整套课程的主要内容,该套课程由生信自学网提供,各位感兴趣的学员可以关注我们的公众号或者通过下方的联系方式购买我们的课程。
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