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TCPA数据库数据整理利用impute包补充缺失值

时间:2020-01-28 12:00来源:生信自学网 作者:乐伟 点击:
TCPA数据库数据整理利用impute包补充缺失值
TCPA数据库数据整理
下载的数据中,有些癌症有缺失值,这个时候就需要对数据进行整理,用R包对缺失值进行填充。

这里用到的R包是Bioconductor – impute包
安装方法:
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")

BiocManager::install("impute")

安装好之后调用R包:library(impute)
用到的函数时imupute.knn()
处理完之后把数据保存好用于后续分析,这样就把缺失值都补充好了,数据整理完毕,进行接下来的分析

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